基因页：GABRB2

概括？
基因 2561
象征 GABRB2
同义词 -
描述 γ-氨基丁酸A型受体β2亚基
参考 MIM：600232|HGNC：HGNC：4082|ENSEMBL：ENSG00000145864|HPRD：02578|Vega：Otthumg00000130349
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q34
Pascal P值 0.621
胎儿β -0.231

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 2 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0032
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00459
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.01718
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：5
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：31

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0030594 神经递质受体活性 IEA 神经递质（GO期限：5） -
去：0004890 GABA-A受体活性 塔斯 GABA（GO期限：7） 8264558
去：0005254 氯化物通道活性 IEA -
去：0005216 离子通道活动 IEA -
去：0005230 细胞外配体门控离子通道活性 IEA -
GO：0031404 氯离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007268 突触传输 塔斯 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） 8264558
去：0007214 γ-氨基丁酸信号通路 塔斯 GABA，神经递质（GO期限：8） 8264558
去：0006811 离子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0045211 突触后膜 IEA 突触，神经递质（GO期限：5） -
GO：0045202 突触 IEA 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） -
去：0005886 质膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 塔斯 8264558
GO：0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA A受体激活 12 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA受体激活 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome离子通道传输 55 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome配体门控离子通道传输 21 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
怀特福德小儿癌标记 116 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向DN 108 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤神经 129 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 157 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-10 3585 3592 1A，M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-101 3665 3672 1A，M8 HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-135 2331 2338 1A，M8 HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-139 3879 3885 M8 HSA-MIR-139脑 ucuacagugcacgugucu
mir-144 3666 3672 1a HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-19 3642 3648 1a HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-203.1 139 145 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-218 3217 3224 1A，M8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-329 3952 3958 1a HSA-MIR-329脑 aacacaccugguaaccucuuu
HSA-MIR-329脑 aacacaccugguaaccucuuu
mir-455 5527 5533 1a HSA-MIR-455 Uaugugccuuuggacuacaucg
mir-485-3p 2966 2972 1a HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu
mir-496 5577 5584 1A，M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-543 3024 3031 1A，M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-9 4645 4652 1A，M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga