基因页面:ST6GALNAC3
总结吗?
| GeneID | 256435年 |
| 象征 | ST6GALNAC3 |
| 同义词 | PRO7177 | SIAT7C | ST6GALNACIII |猪圈 |
| 描述 | ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2 3-beta-galactosyl-1 3) -N-acetylgalactosaminideα2,6-sialyltransferase 3 |
| 参考 | MIM: 610133|HGNC: HGNC: 19343|运用:ENSG00000184005|HPRD: 15341|织女:OTTHUMG00000009615 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p31.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.072 |
| 胎儿β | 0.727 |
| eGene | 小脑半球 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.02692 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1578978 | chr8 | 118196802 | ST6GALNAC3 | 256435年 | 0.12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0008373 | sialyltransferase活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006486 | 氨基酸的蛋白质糖基化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0000139 | 高尔基体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005794 | 高尔基体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030173 | 不可或缺的高尔基体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG鞘糖脂生物合成GANGLIO系列 | 15 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME O黏蛋白的糖基化有关 | 59 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME终止O多糖生物合成 | 24 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢的蛋白质 | 518年 | 242年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME平移蛋白质改性 | 188年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺未分化癌DN | 537年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HATADA甲基化在肺癌 | 390年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AFFAR YY1目标了 | 214年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 徐gh外源目标 | 85年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 徐gh自分泌的目标 | 268年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由喀斯特IWANAGA致癌PTEN DN | 353年 | 226年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TORCHIA EWSR1 FLI1融合的目标 | 271年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 128 | 836年 | 842年 | 1 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
| hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
| mir - 144 | 834年 | 840年 | m8 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
| miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 231年 | 238年 | 1、m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| mir - 205 | 258年 | 264年 | m8 | hsa - mir - 205 | UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG |
| miR-27 | 836年 | 843年 | 1、m8 | hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
| hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
| mir - 543 | 2066年 | 2072年 | 1 | hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |