基因页面:TCERG1L
总结吗?
| GeneID | 256536年 |
| 象征 | TCERG1L |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 转录延伸调节器1 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 23533|运用:ENSG00000176769|HPRD: 18170|织女:OTTHUMG00000019276 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 10 q26.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.469 |
| 夏洛克假定值 | 0.035 |
| eGene | 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.03487 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16827037 | chr3 | 117203284 | TCERG1L | 256536年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs614566 | chr3 | 182847389 | TCERG1L | 256536年 | 0.2 | 反式 | ||
| rs16891454 | chr8 | 42485539 | TCERG1L | 256536年 | 0.07 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| SCHAEFFER前列腺癌发展48小时DN | 428年 | 306年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 153 | 243年 | 249年 | 1 | hsa - mir - 153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
| mir - 216 | 701年 | 707年 | m8 | hsa - mir - 216 | UAAUCUCAGCUGGCAACUGUG |
| mir - 299 - 5 - p | 764年 | 770年 | 1 | hsa - mir - 299 - 5 - p | UGGUUUACCGUCCCACAUACAU |
| mir - 381 | 722年 | 728年 | 1 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
| mir - 448 | 243年 | 249年 | 1 | hsa - mir - 448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU |
| mir - 493 - 5 - p | 643年 | 649年 | 1 | hsa - mir - 493 - 5 - p | UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU |
| mir - 494 | 154年 | 160年 | 1 | hsa - mir - 494大脑 | UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU |
| mir - 539 | 709年 | 715年 | 1 | hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |