基因页：gabrg2
概括？
| 基因 | 2566 |
| 象征 | gabrg2 |
| 同义词 | CAE2 | ECA2 | GEFSP3 |
| 描述 | Aγ-氨基丁酸A型受体γ2亚基 |
| 参考 | MIM：137164|HGNC：HGNC：4087|ENSEMBL：ENSG00000113327|HPRD：00663|Vega：Otthumg00000130350 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q34 |
| Pascal P值 | 1.897E-4 |
| Sherlock P值 | 0.85 |
| 胎儿β | -2.455 |
| 支持 | 配体门控离子信号传导 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00459 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01718 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：6 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AP4M1 | 0.92 | 0.92 |
| SIRT6 | 0.91 | 0.91 |
| actl6b | 0.90 | 0.91 |
| Kat5 | 0.90 | 0.91 |
| ZMYND19 | 0.90 | 0.88 |
| Med22 | 0.90 | 0.90 |
| STK19 | 0.90 | 0.89 |
| ACD | 0.90 | 0.91 |
| miip | 0.90 | 0.89 |
| TRMT1 | 0.89 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.75 | -0.79 |
| AF347015.27 | -0.75 | -0.80 |
| MT-CO2 | -0.75 | -0.78 |
| mt-cyb | -0.75 | -0.80 |
| AF347015.8 | -0.74 | -0.80 |
| AF347015.33 | -0.73 | -0.77 |
| AF347015.15 | -0.72 | -0.79 |
| AF347015.2 | -0.71 | -0.77 |
| AF347015.26 | -0.68 | -0.77 |
| AF347015.21 | -0.67 | -0.80 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0030594 | 神经递质受体活性 | IEA | 神经递质（GO期限：5） | - |
| 去：0004890 | GABA-A受体活性 | IEA | GABA（GO期限：7） | - |
| 去：0008503 | 苯二氮卓受体活性 | 塔斯 | GABA，神经递质（GO期限：6） | 2538761 |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 9892355 | |
| 去：0005254 | 氯化物通道活性 | IEA | - | |
| 去：0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
| 去：0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | IEA | - | |
| GO：0031404 | 氯离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007214 | γ-氨基丁酸信号通路 | IEA | GABA，神经递质（GO期限：8） | - |
| 去：0007214 | γ-氨基丁酸信号通路 | 塔斯 | GABA，神经递质（GO期限：8） | 2538761 |
| 去：0006821 | 氯化物运输 | IEA | - | |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 2538761 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GABA A受体激活 | 12 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GABA受体激活 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome离子通道传输 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome配体门控离子通道传输 | 21 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典 | 62 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pomeroy髓母细胞瘤预后DN | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen Leomomyosarcoma CNN1 UP | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-103/107 | 2141 | 2148 | 1A，M8 | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
| HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
| mir-150 | 1911 | 1918年 | 1A，M8 | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
| mir-493-5p | 527 | 534 | 1A，M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
| mir-496 | 537 | 543 | 1a | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
| HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc | ||||