基因页:Serinc5
概括?
基因 | 256987 |
象征 | Serinc5 |
同义词 | C5orf12 | TPO1 |
描述 | 丝氨酸掺入器5 |
参考 | MIM:614551|HGNC:HGNC:18825|ENSEMBL:ENSG00000164300|HPRD:12828|Vega:Otthumg00000162563 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q14.1 |
Pascal P值 | 0.038 |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11120206 | CHR1 | 206610593 | Serinc5 | 256987 | 0.17 | 反式 | ||
RS2716734 | CHR2 | 39947720 | Serinc5 | 256987 | 0.02 | 反式 | ||
RS2716736 | CHR2 | 39947946 | Serinc5 | 256987 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0042552 | 髓鞘 | IEA | 神经元,轴突,大脑,少突胶质细胞(GO术语级别:13) | - |
去:0008654 | 磷脂生物合成过程 | IEA | - | |
去:0006658 | 磷脂酰丝氨酸代谢过程 | ISS | - | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | IEA | - | |
GO:0051347 | 转移酶活性的阳性调节 | ISS | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0043209 | 髓鞘 | IEA | 神经元,轴突,少突胶质细胞,神经胶质(GO期限:7) | - |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
去:0005783 | 内质网 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bilban b cll lpl up | 63 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hummel Burkitts淋巴瘤 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Scibetta KDM5B靶向DN | 81 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53和TP63目标 | 205 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mantovani病毒GPCR信号向上 | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jeon Smad6靶向 | 24 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 | 182 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein少突胶质细胞 | 74 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |