概括
基因 256987
象征 Serinc5
同义词 C5orf12 | TPO1
描述 丝氨酸掺入器5
参考 MIM:614551|HGNC:HGNC:18825|ENSEMBL:ENSG00000164300|HPRD:12828|Vega:Otthumg00000162563
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q14.1
Pascal P值 0.038
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11120206 CHR1 206610593 Serinc5 256987 0.17 反式
RS2716734 CHR2 39947720 Serinc5 256987 0.02 反式
RS2716736 CHR2 39947946 Serinc5 256987 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0042552 髓鞘 IEA 神经元,轴突,大脑,少突胶质细胞(GO术语级别:13) -
去:0008654 磷脂生物合成过程 IEA -
去:0006658 磷脂酰丝氨酸代谢过程 ISS -
去:0006629 脂质代谢过程 IEA -
GO:0051347 转移酶活性的阳性调节 ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0043209 髓鞘 IEA 神经元,轴突,少突胶质细胞,神经胶质(GO期限:7) -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005783 内质网 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 201 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bilban b cll lpl up 63 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hummel Burkitts淋巴瘤 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scibetta KDM5B靶向DN 81 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53和TP63目标 205 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mantovani病毒GPCR信号向上 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jeon Smad6靶向 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein少突胶质细胞 74 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因