基因页：GAD1

概括？
基因 2571
象征 GAD1
同义词 CPSQ1 | GAD | SCP
描述 谷氨酸脱羧酶1
参考 MIM：605363|HGNC：HGNC：4092|ENSEMBL：ENSG00000128683|HPRD：12011|Vega：Otthumg0000000044175
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q31
Pascal P值 0.071
Sherlock P值 0.177
胎儿β -1.46
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：4
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：31

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
fut1 0.81 0.68
fign 0.79 0.57
OPRM1 0.76 0.66
RNF220 0.75 0.40
TCF7L2 0.74 0.55
COL23A1 0.74 0.60
epha1 0.73 0.24
LHX9 0.73 0.01
mast4 0.72 0.52
GBX2 0.72 0.35
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLA -0.29 -0.28
Neurod6 -0.28 -0.36
Neurod2 -0.27 -0.32
AC087491.1 -0.27 -0.44
uxt -0.27 -0.51
CSRP2 -0.27 -0.53
klhl1 -0.27 -0.23
RPL37 -0.27 -0.59
TMEM108 -0.26 -0.23
TTC28 -0.26 -0.22

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0004351 谷氨酸脱羧酶活性 艾达 谷氨酸（GO期限：6） 10671565
去：0005515 蛋白质结合 IPI 10671565
GO：0016829 裂解酶活性 IEA -
GO：0016831 羧基活性 IEA -
去：0030170 吡啶还毒素结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007268 突触传输 塔斯 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） 8954991
去：0006540 谷氨酸脱羧为琥珀酸酯 塔斯 GABA，谷氨酸，脑，神经递质（GO术语级别：10） 1549570
GO：0042136 神经递质生物合成过程 IEA 神经元，轴突，突触，神经递质（GO术语级别：9） -
GO：0018352 蛋白质 - 吡啶-5-磷酸连接 塔斯 10671565
GO：0019752 羧酸代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0012506 囊泡膜 nas 10671565
去：0005622 细胞内 艾达 10671565

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Kegg丙氨酸天冬氨酸和谷氨酸代谢 32 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg beta丙氨酸代谢 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg牛磺酸和低龙代谢 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg butanoate代谢 34 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG I型糖尿病 44 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta神经递质途径 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经递质释放周期 34 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA合成释放再摄取和降解 17 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边结肠癌MSI与MSS UP 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Appierto对Fenretinide的反应 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
8p缺失DN的Seitz肿瘤转化 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王HCP前列腺癌 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 83 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向DN 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chesler Brain D6MIT150 QTL Trans 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yu Myc针对DN 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔衰老肾脏无血DN 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦卡因可卡因奖励5D 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
结肠癌中甲基化的甲基化 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
huper乳房基础与腔内DN 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hunsberger运动调节基因 31 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向 139 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Madan DPPA4目标 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 1197 1203 M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-146 1016 1022 1a HSA-MIR-146A ugagaacugaauuccaugggug
HSA-MIR-146B脑 ugagaacugaauuccauaggcu
mir-19 192 198 1a HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-24 824 830 1a HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-381 739 745 M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-410 773 779 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-493-5p 216 222 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-9 828 834 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga