基因页面:SHPRH
总结吗?
| GeneID | 257218年 |
| 象征 | SHPRH |
| 同义词 | bA545I5.2 |
| 描述 | SNF2组蛋白链接器博士环解旋酶 |
| 参考 | MIM: 608048|HGNC: HGNC: 19336|运用:ENSG00000146414|HPRD: 10476|织女:OTTHUMG00000015750 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 q24.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.647 |
| 夏洛克假定值 | 0.417 |
| 胎儿β | 1.63 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg26814539 | 6 | 146285614 | SHPRH | 4.44 e-9 | -0.011 | 2.62 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs11670955 | chr19 | 45022696 | SHPRH | 257218年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs12982449 | chr19 | 45024580 | SHPRH | 257218年 | 0.04 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 桑塞姆APC需要MYC的目标 | 210年 | 123年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 丰田MIR34B和MIR34C的目标 | 463年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |