基因页面:PRPF40B
总结吗?
| GeneID | 25766年 |
| 象征 | PRPF40B |
| 同义词 | HYPC |
| 描述 | pre-mRNA 40同族体B处理因素 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 25031|运用:ENSG00000110844|HPRD: 11044|织女:OTTHUMG00000169568 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 12 q13.12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.053 |
| DMG | 2(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 3 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 3 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg10727759 | 12 | 50017361 | PRPF40B | 4.73 e-6 | -0.274 | 0.01 | DMG: Wockner_2014 |
| cg05165862 | 12 | 50030609 | PRPF40B | 4.043的军医 | 0.335 | 0.044 | DMG: Wockner_2014 |
| cg08512940 | 12 | 50016787 | PRPF40B | -0.018 | 0.6 | DMG: Nishioka_2013 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GLOD4 | 0.92 | 0.93 |
| C9orf30 | 0.91 | 0.91 |
| SUMO2 | 0.91 | 0.94 |
| PPM1G | 0.91 | 0.91 |
| ARMCX1 | 0.90 | 0.92 |
| BOP1 | 0.90 | 0.92 |
| CYTH2 | 0.90 | 0.93 |
| ZNF830 | 0.90 | 0.92 |
| ZNF259 | 0.90 | 0.90 |
| ARPC5 | 0.90 | 0.93 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| HLA-F | -0.76 | -0.81 |
| TSC22D4 | -0.75 | -0.82 |
| HEPN1 | -0.75 | -0.80 |
| MT-CO2 | -0.74 | -0.84 |
| AF347015.31 | -0.74 | -0.84 |
| AF347015.33 | -0.74 | -0.85 |
| TINAGL1 | -0.72 | -0.79 |
| MT-CYB | -0.72 | -0.84 |
| AIFM3 | -0.72 | -0.77 |
| FXYD1 | -0.71 | -0.82 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG剪接体 | 128年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标C | 170年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |