基因页：NGEF

Summary？
GeneID 25791
象征 NGEF
同义词 arhgef27 | ephexin
描述 神经鸟嘌呤核苷酸交换因子
参考 MIM：605991|HGNC：HGNC：7807|Ensembl：ENSG0000000066248|HPRD：10442|Vega：Otthumg00000133272
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2Q37
Pascal P值 7.285e-12
Sherlock P值 0.901
胎儿β -2.541
DMG 1（＃研究）
主持人 元
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历：RIPKE_2013 全基因组协会研究 Multi-stage GWAS, Sweden population and PGC2. 24 leading SNPs
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
LK：是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG06828015 2 233793120 NGEF 2.59E-8 -0.017 8.28e-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005089 Rho鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
去：0005085 鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007399 神经系统的发展 IEA 神经突（GO期限：5） -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
去：0030154 细胞分化 IEA -
GO：0035023 调节Rho蛋白信号转导的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0042995 细胞投影 IEA Axon（GO术语级别：4） -
去：0005622 细胞内 IEA -
去：0005737 细胞质 IEA -
GO:0016020 膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid rhoa reg途径 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CDC42 REG PATHWAY 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Epha FWDPathway 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Rac1 Reg Pathway 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rho GTPases的Reactome信号传导 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Nrage通过JNK发出死亡的信号 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞死亡信号通过Nrage NRIF和NADE传导 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 81 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha1213信号传导事件 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 UP 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化克拉斯 126 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa永远转变 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HATADA甲基化在肺癌DN中 38 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM6 46 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇0的时间反应0 76 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙血清敏感基因 90 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-155 758 764 1a HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
MiR-200BC/429 240 247 1A，M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-485-5p 551 557 M8 HSA-MIR-485-5p aggcuggccgugaugauuc