基因页:CIZ1
概括?
基因 | 25792 |
象征 | CIZ1 |
同义词 | LSFR1 | NP94 | ZNF356 |
描述 | CDKN1A相互作用的锌指蛋白1 |
参考 | MIM:611420|HGNC:HGNC:16744|ENSEMBL:ENSG00000148337|HPRD:13061|Vega:Otthumg00000020735 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9q34.1 |
Pascal P值 | 0.029 |
Sherlock P值 | 0.147 |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14409940 | 9 | 130967820 | CIZ1; DNM1 | 2.485e-4 | 0.432 | 0.037 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1507047 | CHR16 | 50932778 | CIZ1 | 25792 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CIZ1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
BRWD3 | 0.93 | 0.91 |
Anp32a | 0.90 | 0.89 |
ZNF714 | 0.88 | 0.90 |
HNRNPA1P2 | 0.88 | 0.79 |
csgalnact2 | 0.88 | 0.90 |
RSL1D1 | 0.88 | 0.82 |
USP3 | 0.88 | 0.77 |
ZNF431 | 0.88 | 0.86 |
C16orf87 | 0.88 | 0.87 |
放 | 0.87 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TNFSF12 | -0.63 | -0.70 |
HLA-F | -0.62 | -0.79 |
AIFM3 | -0.61 | -0.77 |
pth1r | -0.61 | -0.75 |
TSC22D4 | -0.60 | -0.81 |
C5orf53 | -0.60 | -0.73 |
SLC16A11 | -0.60 | -0.69 |
RAMP1 | -0.59 | -0.80 |
AF347015.31 | -0.59 | -0.85 |
LHPP | -0.59 | -0.62 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
lau凋亡CDKN2A UP | 55 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应120 MCF10A | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园HSC和多能祖先 | 50 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild E2F3致癌特征 | 246 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra靶向DN | 105 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |