概括
基因 25792
象征 CIZ1
同义词 LSFR1 | NP94 | ZNF356
描述 CDKN1A相互作用的锌指蛋白1
参考 MIM:611420|HGNC:HGNC:16744|ENSEMBL:ENSG00000148337|HPRD:13061|Vega:Otthumg00000020735
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9q34.1
Pascal P值 0.029
Sherlock P值 0.147
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14409940 9 130967820 CIZ1; DNM1 2.485e-4 0.432 0.037 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1507047 CHR16 50932778 CIZ1 25792 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
BRWD3 0.93 0.91
Anp32a 0.90 0.89
ZNF714 0.88 0.90
HNRNPA1P2 0.88 0.79
csgalnact2 0.88 0.90
RSL1D1 0.88 0.82
USP3 0.88 0.77
ZNF431 0.88 0.86
C16orf87 0.88 0.87
0.87 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TNFSF12 -0.63 -0.70
HLA-F -0.62 -0.79
AIFM3 -0.61 -0.77
pth1r -0.61 -0.75
TSC22D4 -0.60 -0.81
C5orf53 -0.60 -0.73
SLC16A11 -0.60 -0.69
RAMP1 -0.59 -0.80
AF347015.31 -0.59 -0.85
LHPP -0.59 -0.62

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
lau凋亡CDKN2A UP 55 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿米特血清反应120 MCF10A 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园HSC和多能祖先 50 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild E2F3致癌特征 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra靶向DN 105 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因