基因页:FBXO7
概括?
基因 | 25793 |
象征 | FBXO7 |
同义词 | FBX | FBX07 | FBX7 | PARK15 | PKPS |
描述 | F-box蛋白7 |
参考 | MIM:605648|HGNC:HGNC:13586|ENSEMBL:ENSG00000100225|HPRD:07292|Vega:Otthumg00000030674 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q12.3 |
Pascal P值 | 0.495 |
Sherlock P值 | 0.566 |
胎儿β | -0.656 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 皮质 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
FBXO7 | CHR22 | 32875203 | C | t | NM_001033024 NM_001257990 NM_012179 |
p.41p> s p.6p> s p.120p> s |
错过 错过 错过 |
精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS5754120 | 22 | 32899858 | FBXO7 | ENSG00000100225.13 | 1.34127E-6 | 0.04 | 29195 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FBXO7_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15145941 | |
去:0004842 | 泛素 - 蛋白连接酶活性 | 塔斯 | 10531035 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | 塔斯 | 10531035 | |
GO:0031647 | 蛋白质稳定性调节 | 艾达 | 15145941 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000151 | 泛素连接酶复合物 | 塔斯 | 10531035 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dittmer PTHLH靶向DN | 73 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |