概括
基因 25793
象征 FBXO7
同义词 FBX | FBX07 | FBX7 | PARK15 | PKPS
描述 F-box蛋白7
参考 MIM:605648|HGNC:HGNC:13586|ENSEMBL:ENSG00000100225|HPRD:07292|Vega:Otthumg00000030674
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q12.3
Pascal P值 0.495
Sherlock P值 0.566
胎儿β -0.656
主持人 前扣带回皮层BA24
皮质
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
FBXO7 CHR22 32875203 C t NM_001033024
NM_001257990
NM_012179
p.41p> s
p.6p> s
p.120p> s
错过
错过
错过
精神分裂症 DNM:XU_2012

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS5754120 22 32899858 FBXO7 ENSG00000100225.13 1.34127E-6 0.04 29195 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15145941
去:0004842 泛素 - 蛋白连接酶活性 塔斯 10531035
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 塔斯 10531035
GO:0031647 蛋白质稳定性调节 艾达 15145941
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000151 泛素连接酶复合物 塔斯 10531035

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer PTHLH靶向DN 73 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因