基因页:Bri3
概括?
基因 | 25798 |
象征 | Bri3 |
同义词 | i3 |
描述 | 脑蛋白I3 |
参考 | MIM:615628|HGNC:HGNC:1109|ENSEMBL:ENSG00000164713|HPRD:16562|Vega:Otthumg00000154275 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q21.3 |
Pascal P值 | 0.244 |
胎儿β | 0.27 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14640481 | 7 | 97910728 | Bri3 | -0.024 | 0.7 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BRI3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Rab11fip2 | 0.93 | 0.93 |
DMXL2 | 0.92 | 0.92 |
AKAP11 | 0.92 | 0.92 |
FBXL17 | 0.92 | 0.92 |
cltc | 0.91 | 0.92 |
OPA1 | 0.91 | 0.90 |
Col4a3bp | 0.91 | 0.91 |
UBR3 | 0.91 | 0.91 |
DMXL1 | 0.90 | 0.88 |
ATP6V1A | 0.90 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
EIF4EBP3 | -0.58 | -0.66 |
FXYD1 | -0.55 | -0.58 |
AF347015.21 | -0.54 | -0.56 |
ACSF2 | -0.53 | -0.61 |
MT-CO2 | -0.52 | -0.58 |
AP002478.3 | -0.52 | -0.60 |
TLCD1 | -0.52 | -0.55 |
C1orf61 | -0.52 | -0.68 |
GSDMD | -0.52 | -0.57 |
PLA2G5 | -0.51 | -0.57 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌7Q21 Q22 AMPLICON | 76 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UEDA PERIFERAL CHICK | 169 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |