基因页：vax2
概括？
| 基因 | 25806 |
| 象征 | vax2 |
| 同义词 | Dres93 |
| 描述 | 腹前同源2 |
| 参考 | MIM：604295|HGNC：HGNC：12661|ENSEMBL：ENSG00000116035|HPRD：05051|Vega：Otthumg00000129714 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2P13 |
| Pascal P值 | 0.963 |
| 胎儿β | -0.297 |
| DMG | 2（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 3 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG20267441 | 2 | 71127363 | vax2 | 9.8e-5 | -0.265 | 0.028 | DMG：Wockner_2014 |
| CG01719210 | 2 | 71128191 | vax2 | 4.91E-4 | -0.263 | 0.047 | DMG：Wockner_2014 |
| CG15423212 | 2 | 71115225 | vax2 | 3.54e-8 | -0.016 | 1.03E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ube4b | 0.96 | 0.96 |
| dyrk1a | 0.96 | 0.96 |
| HERC1 | 0.95 | 0.95 |
| Huwe1 | 0.95 | 0.96 |
| CKAP5 | 0.95 | 0.96 |
| gon4l | 0.95 | 0.96 |
| KIAA0947 | 0.95 | 0.96 |
| KIAA1409 | 0.95 | 0.95 |
| RPRD2 | 0.95 | 0.96 |
| TP53BP1 | 0.94 | 0.94 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.81 | -0.85 |
| higd1b | -0.79 | -0.86 |
| FXYD1 | -0.79 | -0.83 |
| MT-CO2 | -0.79 | -0.84 |
| ifi27 | -0.78 | -0.84 |
| AF347015.21 | -0.76 | -0.87 |
| AF347015.33 | -0.76 | -0.78 |
| AF347015.27 | -0.75 | -0.79 |
| AF347015.8 | -0.75 | -0.81 |
| S100A16 | -0.74 | -0.79 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003700 | 转录因子活性 | nas | 10485894 | |
| GO：0031490 | 染色质DNA结合 | IEA | - | |
| GO：0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007409 | 轴突发生 | IEA | 神经元，轴突，神经突（GO期限：12） | - |
| GO：0000122 | RNA聚合酶II启动子的转录负调控 | IEA | - | |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0009950 | 背/腹轴规范 | IEA | - | |
| 去：0007398 | 外胚层开发 | 塔斯 | 10485894 | |
| GO：0048048 | 胚胎的形态发生 | IEA | - | |
| 去：0007601 | 视觉感知 | 塔斯 | 10485894 | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0043010 | 相机型眼睛开发 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |