概括
基因 25831
象征 hectd1
同义词 欧利尔
描述 HECT结构域E3泛素蛋白连接酶1
参考 HGNC:HGNC:20157|Ensembl:ENSG0000000092148|HPRD:17098|Vega:Otthumg00000170670
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q12
Pascal P值 0.002
Sherlock P值 0.114
胎儿β -0.161
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.047

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
hectd1 CHR14 31647323 一个 G NM_015382 p.93v> a 错过 精神分裂症 DNM:XU_2012


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005488 捆绑 IEA -
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
GO:0016881 酸 - 氨基酸连接酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001843 神经管闭合 IEA -
去:0006464 蛋白质修饰过程 IEA -
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1靶向DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王食道癌与正常DN 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 213 219 M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-142-3p 358 365 1A,M8 HSA-MIR-142-3P uguaguuuccuacuuuaugga
mir-145 242 248 1a HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-15/16/195/424/497 155 161 1a HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-369-3p 722 728 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 722 729 1A,M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-381 717 723 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-503 155 161 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag