基因页:POU2F3
概括?
基因 | 25833 |
象征 | POU2F3 |
同义词 | EPOC-1 | OCT-11 | OCT11 | OTF-11 | PLA-1 | PLA1 | SKN-1A |
描述 | POU 2级同型3 |
参考 | MIM:607394|HGNC:HGNC:19864|ENSEMBL:ENSG00000137709|HPRD:09582|Vega:Otthumg00000166140 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q23.3 |
Pascal P值 | 2.248E-4 |
主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1474539 | CHR8 | 133946088 | POU2F3 | 25833 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ABCC9 | 0.79 | 0.76 |
PCDHGC3 | 0.77 | 0.79 |
ITPR2 | 0.76 | 0.76 |
NPAS3 | 0.75 | 0.81 |
BMPR1B | 0.75 | 0.75 |
PPAP2B | 0.73 | 0.68 |
LRIG1 | 0.73 | 0.76 |
rin2 | 0.73 | 0.77 |
PDLIM5 | 0.71 | 0.66 |
MCC | 0.71 | 0.73 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C20ORF7 | -0.32 | -0.36 |
克里姆 | -0.32 | -0.29 |
AC034193.4 | -0.31 | -0.37 |
RGS6 | -0.30 | -0.20 |
NDUFA2 | -0.30 | -0.34 |
TIMM10 | -0.29 | -0.24 |
MRPL33 | -0.29 | -0.32 |
COX5A | -0.29 | -0.32 |
Glrx | -0.29 | -0.31 |
COX7B | -0.29 | -0.32 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12624109 | |
GO:0043565 | 序列特异性DNA结合 | 艾达 | 9242494 | |
GO:0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0006357 | 调节RNA聚合酶II启动子的转录 | 塔斯 | 10473598 | |
去:0008544 | 表皮发展 | 塔斯 | 10473598 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 9242494 | |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Streicher LSM1靶向 | 44 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化 | 77 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化HBZ | 41 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化hemgn | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dacosta低剂量紫外线通过ERCC3 XPC向上 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭亮氨酸剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Duan PRDM5目标 | 79 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-135 | 1438 | 1444 | M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
mir-323 | 889 | 895 | M8 | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |