概括
基因 25833
象征 POU2F3
同义词 EPOC-1 | OCT-11 | OCT11 | OTF-11 | PLA-1 | PLA1 | SKN-1A
描述 POU 2级同型3
参考 MIM:607394|HGNC:HGNC:19864|ENSEMBL:ENSG00000137709|HPRD:09582|Vega:Otthumg00000166140
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q23.3
Pascal P值 2.248E-4
主持人 皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1474539 CHR8 133946088 POU2F3 25833 0.2 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ABCC9 0.79 0.76
PCDHGC3 0.77 0.79
ITPR2 0.76 0.76
NPAS3 0.75 0.81
BMPR1B 0.75 0.75
PPAP2B 0.73 0.68
LRIG1 0.73 0.76
rin2 0.73 0.77
PDLIM5 0.71 0.66
MCC 0.71 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C20ORF7 -0.32 -0.36
克里姆 -0.32 -0.29
AC034193.4 -0.31 -0.37
RGS6 -0.30 -0.20
NDUFA2 -0.30 -0.34
TIMM10 -0.29 -0.24
MRPL33 -0.29 -0.32
COX5A -0.29 -0.32
Glrx -0.29 -0.31
COX7B -0.29 -0.32

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 12624109
GO:0043565 序列特异性DNA结合 艾达 9242494
GO:0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006357 调节RNA聚合酶II启动子的转录 塔斯 10473598
去:0008544 表皮发展 塔斯 10473598
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 艾达 9242494
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Streicher LSM1靶向 44 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化 77 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化HBZ 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化hemgn 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dacosta低剂量紫外线通过ERCC3 XPC向上 18 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 79 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Duan PRDM5目标 79 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-135 1438 1444 M8 HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-323 889 895 M8 HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu