基因页面:SUMF2
总结吗?
| GeneID | 25870年 |
| 象征 | SUMF2 |
| 同义词 | 但是脉冲场凝胶电泳的出现 |
| 描述 | 硫酸酯酶修饰基因2 |
| 参考 | MIM: 607940|HGNC: HGNC: 20415|运用:ENSG00000129103|HPRD: 06400|织女:OTTHUMG00000129373 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 q11.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.025 |
| 夏洛克假定值 | 0.744 |
| 胎儿β | 1.062 |
| DMG | 2(#研究) |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: vanEijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括432个不同甲基化CpG网站对应391精神分裂症患者之间独特的成绩单(n = 260)和对照组(n = 250)的影响。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg26790897 | 7 | 56147772 | SUMF2 | 1.384的军医 | -0.578 | 0.031 | DMG: Wockner_2014 |
| cg23839680 | 7 | 56118238 | SUMF2 | 4.76 e-5 | 4.424 | DMG: vanEijk_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs802402 | chr7 | 90615513 | SUMF2 | 25870年 | 0.02 | 反式 | ||
| rs35791463 | 7 | 56071490 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 1.814 e-6 | 0.01 | -60205年 | gtex_brain_ba24 |
| rs28438587 | 7 | 56073544 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 4.181 e - | 0.01 | -58151年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12154781 | 7 | 56074020 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 4.089 e - | 0.01 | -57675年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12155441 | 7 | 56074118 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 4.076 e - | 0.01 | -57577年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6970842 | 7 | 56077235 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 3.988 e - | 0.01 | -54460年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73140779 | 7 | 56089807 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 8.687 e - | 0.01 | -41888年 | gtex_brain_ba24 |
| rs55940597 | 7 | 56090668 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 1.122 e-6 | 0.01 | -41027年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10265826 | 7 | 56091622 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.289 e - | 0.01 | -40073年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10274148 | 7 | 56093454 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.298 e - | 0.01 | -38241年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73140793 | 7 | 56105326 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.397 e - | 0.01 | -26369年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73140794 | 7 | 56105378 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.397 e - | 0.01 | -26317年 | gtex_brain_ba24 |
| rs59723101 | 7 | 56106166 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.403 e - | 0.01 | -25529年 | gtex_brain_ba24 |
| rs113152440 | 7 | 56106308 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.404 e - | 0.01 | -25387年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2002651 | 7 | 56109770 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 1.617 e-6 | 0.01 | -21925年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2016724 | 7 | 56110766 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 1.982 e-6 | 0.01 | -20929年 | gtex_brain_ba24 |
| rs58251663 | 7 | 56111475 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 8.997 e - | 0.01 | -20220年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4424212 | 7 | 56117409 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.492 e - | 0.01 | -14286年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4427122 | 7 | 56117707 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.495 e - | 0.01 | -13988年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6960348 | 7 | 56124240 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.555 e - | 0.01 | -7455年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12671494 | 7 | 56125527 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.566 e - | 0.01 | -6168年 | gtex_brain_ba24 |
| rs766334 | 7 | 56126713 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.905 e - | 0.01 | -4982年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2014042 | 7 | 56126947 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.908 e - | 0.01 | -4748年 | gtex_brain_ba24 |
| rs3813505 | 7 | 56132122 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.951 e - | 0.01 | 427年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7793614 | 7 | 56133204 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.96 e - | 0.01 | 1509年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4585698 | 7 | 56134265 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.972 e - | 0.01 | 2570年 | gtex_brain_ba24 |
| rs13242830 | 7 | 56134501 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 2.071 e-6 | 0.01 | 2806年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4345511 | 7 | 56135458 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 8.206 e - | 0.01 | 3763年 | gtex_brain_ba24 |
| rs9767946 | 7 | 56135970 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 1.71 e-6 | 0.01 | 4275年 | gtex_brain_ba24 |
| rs34809359 | 7 | 56138322 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 8.01 e - | 0.01 | 6627年 | gtex_brain_ba24 |
| rs13244654 | 7 | 56146956 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 1.517 e-6 | 0.01 | 15261年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2242509 | 7 | 56151526 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.967 e - | 0.01 | 19831年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12673255 | 7 | 56158581 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.959 e - | 0.01 | 26886年 | gtex_brain_ba24 |
| rs13438048 | 7 | 56161138 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.959 e - | 0.01 | 29443年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12536548 | 7 | 56163988 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.959 e - | 0.01 | 32293年 | gtex_brain_ba24 |
| rs74917128 | 7 | 56165202 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 9.649 e - | 0.01 | 33507年 | gtex_brain_ba24 |
| rs60462402 | 7 | 56165311 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 3.546 e - | 0.01 | 33616年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12537948 | 7 | 56165768 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.959 e - | 0.01 | 34073年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6947671 | 7 | 56167991 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.959 e - | 0.01 | 36296年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12668193 | 7 | 56172378 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 8.716 e - | 0.01 | 40683年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6971804 | 7 | 56173816 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.893 e - | 0.01 | 42121年 | gtex_brain_ba24 |
| rs28558245 | 7 | 56175923 | SUMF2 | ENSG00000129103.13 | 7.82 e - | 0.01 | 44228年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| U2AF2 | 0.96 | 0.97 |
| DVL3 | 0.95 | 0.95 |
| DGCR14 | 0.95 | 0.95 |
| DAXX | 0.94 | 0.94 |
| RBM10 | 0.94 | 0.95 |
| CXXC1 | 0.94 | 0.95 |
| EWSR1 | 0.94 | 0.97 |
| AC011498.3 | 0.94 | 0.95 |
| PRKCSH | 0.94 | 0.94 |
| RANBP3 | 0.94 | 0.94 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.81 | -0.88 |
| MT-CO2 | -0.80 | -0.88 |
| AF347015.27 | -0.78 | -0.88 |
| AF347015.33 | -0.78 | -0.87 |
| MT-CYB | -0.77 | -0.85 |
| AF347015.8 | -0.75 | -0.85 |
| C5orf53 | -0.74 | -0.76 |
| AF347015.21 | -0.73 | -0.88 |
| FXYD1 | -0.73 | -0.82 |
| AF347015.2 | -0.73 | -0.85 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME天车伽马羧化作用HYPUSINE形成和ARYLSULFATASE激活 | 27 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME鞘糖脂代谢 | 38 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME磷脂代谢 | 198年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME ARYLSULFATASES的激活 | 12 | 5 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢的蛋白质 | 518年 | 242年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME鞘脂类代谢 | 69年 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME平移蛋白质改性 | 188年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢脂质和脂蛋白 | 478年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开回应前列腺素E2 DN | 391年 | 222年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YAUCH刺猬信号旁分泌 | 149年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大与H3K4ME3 ICP | 445年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |