基因页面:C3orf17
总结吗?
GeneID | 25871年 |
象征 | C3orf17 |
同义词 | NEPRO | NET17 |
描述 | 3号染色体开放阅读框17 |
参考 | HGNC: HGNC: 24496|运用:ENSG00000163608|HPRD: 08524|织女:OTTHUMG00000159286 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 3 q13.2 |
帕斯卡假定值 | 0.485 |
夏洛克假定值 | 0.673 |
胎儿β | 0.953 |
DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04359 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.04047 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg02856124 | 3 | 112736847 | C3orf17 | 5.386的军医 | -0.397 | 0.048 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C3orf17_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
WDR48 | 0.97 | 0.97 |
HMG20A | 0.96 | 0.97 |
CTCF | 0.96 | 0.98 |
YTHDF2 | 0.96 | 0.96 |
ZNF776 | 0.96 | 0.96 |
SUPT16H | 0.96 | 0.97 |
ZNF518B | 0.96 | 0.97 |
PHF20 | 0.96 | 0.96 |
WDR82 | 0.96 | 0.97 |
VEZT | 0.96 | 0.96 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.78 | -0.92 |
MT-CO2 | -0.77 | -0.91 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.89 |
AIFM3 | -0.77 | -0.81 |
TSC22D4 | -0.76 | -0.83 |
S100B | -0.76 | -0.85 |
AF347015.33 | -0.75 | -0.86 |
IFI27 | -0.75 | -0.89 |
AF347015.27 | -0.75 | -0.86 |
HSD17B14 | -0.75 | -0.83 |
第三部分。基因本体论注释
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
里克曼肿瘤分化好与差 | 236年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼转移了 | 344年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NOUZOVA维甲酸和H4乙酰化作用 | 143年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |