基因页面:CHRDL2

总结吗?
GeneID 25884年
象征 CHRDL2
同义词 BNF1 | CHL2
描述 chordin-like 2
参考 MIM: 613127|HGNC: HGNC: 24168|运用:ENSG00000054938|HPRD: 09881|织女:OTTHUMG00000165623
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 11 q14
帕斯卡假定值 0.007
eGene 硬膜基底神经节

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs6592568 11 74275894 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.145 e-6 0.01 166536年 gtex_brain_putamen_basal
rs397691558 11 74276933 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.329 e-6 0.01 165497年 gtex_brain_putamen_basal
rs4944047 11 74278090 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.512 e-6 0.01 164340年 gtex_brain_putamen_basal
rs1433969 11 74278433 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.547 e-6 0.01 163997年 gtex_brain_putamen_basal
rs1971114 11 74281406 CHRDL2 ENSG00000054938.11 2.567 e-6 0.01 161024年 gtex_brain_putamen_basal
rs7952661 11 74281777 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.943 e-6 0.01 160653年 gtex_brain_putamen_basal
rs7937232 11 74281910 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.96 e-6 0.01 160520年 gtex_brain_putamen_basal
rs11236154 11 74283170 CHRDL2 ENSG00000054938.11 2.435 e-6 0.01 159260年 gtex_brain_putamen_basal
rs7935260 11 74293539 CHRDL2 ENSG00000054938.11 2.525 e-6 0.01 148891年 gtex_brain_putamen_basal
rs66901505 11 74295413 CHRDL2 ENSG00000054938.11 2.022 e-6 0.01 147017年 gtex_brain_putamen_basal
rs7934742 11 74311051 CHRDL2 ENSG00000054938.11 2.29 e-6 0.01 131379年 gtex_brain_putamen_basal
rs4944916 11 74322040 CHRDL2 ENSG00000054938.11 2.515 e-6 0.01 120390年 gtex_brain_putamen_basal
rs10857 11 74353371 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.822 e-6 0.01 89059年 gtex_brain_putamen_basal
rs7935057 11 74354783 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.849 e-6 0.01 87647年 gtex_brain_putamen_basal
rs7106984 11 74369359 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.176 e-6 0.01 73071年 gtex_brain_putamen_basal
rs7111251 11 74370191 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.78 e-6 0.01 72239年 gtex_brain_putamen_basal
rs7131096 11 74370356 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.05 e-6 0.01 72074年 gtex_brain_putamen_basal
rs4944936 11 74392514 CHRDL2 ENSG00000054938.11 3.689 e - 0.01 49916年 gtex_brain_putamen_basal
rs11236215 11 74396330 CHRDL2 ENSG00000054938.11 1.066 e-6 0.01 46100年 gtex_brain_putamen_basal

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
线圈 0.96 0.95
DDX21 0.95 0.94
DHX9 0.95 0.95
WDR3 0.95 0.96
XRCC5 0.95 0.94
CCT6A 0.95 0.94
MAPRE1 0.95 0.92
MATR3 0.95 0.95
CAPRIN1 0.94 0.94
XRN2 0.94 0.95
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.74 -0.90
AF347015.31 -0.74 -0.89
HLA-F -0.73 -0.82
MT-CO2 -0.73 -0.90
AF347015.33 -0.73 -0.89
AF347015.27 -0.72 -0.87
C5orf53 -0.72 -0.77
S100B -0.71 -0.84
TSC22D4 -0.71 -0.81
MT-CYB -0.70 -0.87

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
周炎症反应费马 544年 308年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH速度的目标 1062年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH PRC2目标 652年 441年 所有SZGR 2.0基因通路
NIKOLSKY乳腺癌11 q12 Q14扩增子 158年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 435年 318年 所有SZGR 2.0基因通路
通过甲基化NOUSHMEHR GBM沉默 50 32 所有SZGR 2.0基因通路
NABA分泌的因素 344年 197年 所有SZGR 2.0基因通路
NABA MATRISOME相关 753年 411年 所有SZGR 2.0基因通路
NABA MATRISOME 1028年 559年 所有SZGR 2.0基因通路