基因页:POC1A
概括?
基因 | 25886 |
象征 | POC1A |
同义词 | pix2 | soft | wdr51a |
描述 | POC1中心蛋白A |
参考 | MIM:614783|HGNC:HGNC:24488|ENSEMBL:ENSG00000164087|HPRD:08523|Vega:Otthumg00000157817 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21.2 |
Pascal P值 | 0.01 |
Sherlock P值 | 0.59 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2279811 | CHR3 | 59405935 | POC1A | 25886 | 0.15 | 反式 | ||
RS17060560 | CHR3 | 59406495 | POC1A | 25886 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FGFR1 | 0.68 | 0.57 |
LATS2 | 0.66 | 0.56 |
COL2A1 | 0.62 | 0.18 |
boc | 0.61 | 0.44 |
Notch2 | 0.61 | 0.64 |
palld | 0.61 | 0.58 |
heg1 | 0.61 | 0.62 |
tead1 | 0.60 | 0.59 |
Antxr1 | 0.59 | 0.61 |
Frem2 | 0.59 | 0.52 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TTC9B | -0.28 | -0.46 |
Otoa | -0.27 | -0.31 |
NGB | -0.27 | -0.32 |
ZFAND2A | -0.25 | -0.35 |
SLC26A4 | -0.25 | -0.30 |
USMG5 | -0.24 | -0.38 |
SPHAR | -0.23 | -0.29 |
ATP6V0B | -0.23 | -0.34 |
C18orf32 | -0.23 | -0.43 |
TMEM126A | -0.22 | -0.40 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Cycling基因 | 148 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IR响应6小时中的周细胞周期基因 | 85 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
24小时IR响应中的周细胞周期基因 | 128 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |