概括
基因 25886
象征 POC1A
同义词 pix2 | soft | wdr51a
描述 POC1中心蛋白A
参考 MIM:614783|HGNC:HGNC:24488|ENSEMBL:ENSG00000164087|HPRD:08523|Vega:Otthumg00000157817
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.2
Pascal P值 0.01
Sherlock P值 0.59
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2279811 CHR3 59405935 POC1A 25886 0.15 反式
RS17060560 CHR3 59406495 POC1A 25886 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FGFR1 0.68 0.57
LATS2 0.66 0.56
COL2A1 0.62 0.18
boc 0.61 0.44
Notch2 0.61 0.64
palld 0.61 0.58
heg1 0.61 0.62
tead1 0.60 0.59
Antxr1 0.59 0.61
Frem2 0.59 0.52
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TTC9B -0.28 -0.46
Otoa -0.27 -0.31
NGB -0.27 -0.32
ZFAND2A -0.25 -0.35
SLC26A4 -0.25 -0.30
USMG5 -0.24 -0.38
SPHAR -0.23 -0.29
ATP6V0B -0.23 -0.34
C18orf32 -0.23 -0.43
TMEM126A -0.22 -0.40

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Cycling基因 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7靶向1个 194 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IR响应6小时中的周细胞周期基因 85 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
24小时IR响应中的周细胞周期基因 128 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因