基因页:mthfd1l
概括?
基因 | 25902 |
象征 | mthfd1l |
同义词 | fthfsdc1 | mtc1thfs | dj292b18.2 |
描述 | 甲基苯甲酸叶酸脱氢酶(NADP+依赖性)1类样 |
参考 | MIM:611427|HGNC:HGNC:21055|Ensembl:ENSG00000120254|HPRD:09967|Vega:Otthumg0000000015828 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q25.1 |
Pascal P值 | 0.009 |
Sherlock P值 | 0.43 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7763414 | CHR6 | 151405376 | mthfd1l | 25902 | 0.09 | 顺式 | ||
RS7742684 | CHR6 | 151405390 | mthfd1l | 25902 | 0.04 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MTHFD1L_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl11a | 0.88 | 0.75 |
DSCAML1 | 0.88 | 0.73 |
TMPRSS13 | 0.87 | 0.61 |
FOXO6 | 0.87 | 0.82 |
myo5b | 0.87 | 0.67 |
NFYA | 0.86 | 0.79 |
FEZF2 | 0.86 | 0.64 |
foxg1b | 0.86 | 0.82 |
AUTS2 | 0.85 | 0.88 |
SCRT2 | 0.85 | 0.78 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.50 | -0.84 |
PPAP2A | -0.50 | -0.64 |
serpinb6 | -0.49 | -0.62 |
TNFSF12 | -0.49 | -0.62 |
FBXO2 | -0.48 | -0.67 |
HLA-F | -0.48 | -0.71 |
pth1r | -0.48 | -0.63 |
TMEM54 | -0.48 | -0.63 |
AP003117.1 | -0.48 | -0.65 |
me1 | -0.48 | -0.66 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG乙醛酸盐和二羧酸二羧酸盐代谢 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg fule一个碳池 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino DN | 200 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 | 120 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李最近的胸腺移民 | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huang GATA2靶向DN | 72 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |