概括
基因 25902
象征 mthfd1l
同义词 fthfsdc1 | mtc1thfs | dj292b18.2
描述 甲基苯甲酸叶酸脱氢酶(NADP+依赖性)1类样
参考 MIM:611427|HGNC:HGNC:21055|Ensembl:ENSG00000120254|HPRD:09967|Vega:Otthumg0000000015828
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q25.1
Pascal P值 0.009
Sherlock P值 0.43
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7763414 CHR6 151405376 mthfd1l 25902 0.09 顺式
RS7742684 CHR6 151405390 mthfd1l 25902 0.04 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl11a 0.88 0.75
DSCAML1 0.88 0.73
TMPRSS13 0.87 0.61
FOXO6 0.87 0.82
myo5b 0.87 0.67
NFYA 0.86 0.79
FEZF2 0.86 0.64
foxg1b 0.86 0.82
AUTS2 0.85 0.88
SCRT2 0.85 0.78
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.50 -0.84
PPAP2A -0.50 -0.64
serpinb6 -0.49 -0.62
TNFSF12 -0.49 -0.62
FBXO2 -0.48 -0.67
HLA-F -0.48 -0.71
pth1r -0.48 -0.63
TMEM54 -0.48 -0.63
AP003117.1 -0.48 -0.65
me1 -0.48 -0.66

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG乙醛酸盐和二羧酸二羧酸盐代谢 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg fule一个碳池 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 222 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 120 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李最近的胸腺移民 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang GATA2靶向DN 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因