基因页:OLFML2B
概括?
基因 | 25903 |
象征 | OLFML2B |
同义词 | - |
描述 | 嗅蛋白像2B一样 |
参考 | HGNC:HGNC:24558|ENSEMBL:ENSG00000162745|HPRD:14877|Vega:Otthumg00000024047 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q23.3 |
Sherlock P值 | 0.704 |
胎儿β | -1.08 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00814 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2684866 | CHR1 | 162726280 | OLFML2B | 25903 | 0.04 | 顺式 | ||
RS2343485 | CHR1 | 162864622 | OLFML2B | 25903 | 0.03 | 顺式 | ||
RS1986385 | CHR1 | 162872138 | OLFML2B | 25903 | 0.02 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/OLFML2B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZCCHC11 | 0.79 | 0.78 |
vav2 | 0.78 | 0.76 |
ZNF589 | 0.78 | 0.79 |
ZNF211 | 0.78 | 0.78 |
ZCCHC8 | 0.77 | 0.79 |
Exosc10 | 0.77 | 0.77 |
Fignl1 | 0.77 | 0.79 |
ZNF711 | 0.77 | 0.79 |
C21orf66 | 0.77 | 0.75 |
ZNF608 | 0.77 | 0.75 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.63 | -0.70 |
AIFM3 | -0.62 | -0.68 |
TSC22D4 | -0.62 | -0.73 |
S100B | -0.60 | -0.72 |
AF347015.31 | -0.60 | -0.74 |
FBXO2 | -0.60 | -0.62 |
RAMP1 | -0.60 | -0.70 |
AF347015.27 | -0.60 | -0.73 |
FXYD1 | -0.60 | -0.75 |
aldoc | -0.59 | -0.63 |
第三节。基因本体论注释
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 | 142 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 | 143 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ingram SHH目标 | 127 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark Hyppocampus 22Q11删除 | 53 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ruiz TNC目标 | 153 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向 | 221 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
anastassiou癌症间充质过渡特征 | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ghandhi直接辐照DN | 33 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-363 | 224 | 230 | 1a | HSA-MIR-363 | auugcacgguauccaucuguaa |
mir-381 | 113 | 119 | 1a | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |