基因页面:ZDHHC5

总结吗?
GeneID 25921年
象征 ZDHHC5
同义词 DHHC5 | ZNF375
描述 锌指DHHC-type包含5
参考 MIM: 614586|HGNC: HGNC: 18472|运用:ENSG00000156599|HPRD: 15720|织女:OTTHUMG00000167198
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 11 q12.1
帕斯卡假定值 2.32 e -
夏洛克假定值 0.482
这样假定值 0.002
胎儿β -0.663
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 CompositeSet

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
表达式 荟萃分析的基因表达 P值:1.441
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
ZDHHC5 chr11 57466850 G T NM_015457 p.648E > * 废话 精神分裂症 认为:Fromer_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs10834670 chr11 25404015 ZDHHC5 25921年 0.11 反式
rs10834671 chr11 25404269 ZDHHC5 25921年 0.07 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
EXOSC8 0.77 0.78
SNRPF 0.77 0.80
DYNLT1 0.77 0.79
RFC4 0.76 0.77
LSM8 0.75 0.72
PDSS1 0.75 0.74
C14orf109 0.74 0.73
AC106037.2 0.74 0.74
KDELC1 0.74 0.71
CBY1 0.74 0.74
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.57 -0.64
FBXO2 -0.55 -0.58
AF347015.33 -0.54 -0.62
BCL2L2 -0.54 -0.59
2英镑 -0.54 -0.62
HLA-F -0.53 -0.56
AF347015.15 -0.53 -0.63
MT-CYB -0.53 -0.61
MT-CO2 -0.53 -0.59
ARRDC2 -0.52 -0.66

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016740 转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0008415 酰基转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
加里CD5目标了 473年 314年 所有SZGR 2.0基因通路
王LMO4 DN的目标 352年 225年 所有SZGR 2.0基因通路
奥斯曼膀胱癌了 404年 246年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN MC和阿霉素DN 770年 415年 所有SZGR 2.0基因通路
AMUNDSON基因毒性的签名 105年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
道森在淋巴瘤TCL1甲基化 59 45 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼肿瘤分化和管理不善的DN 382年 224年 所有SZGR 2.0基因通路
BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 882年 572年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯应对TRABECTEDIN DN 271年 175年 所有SZGR 2.0基因通路
DURCHDEWALD皮肤致癌DN 264年 168年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1目标了 673年 430年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯DN TP53的目标 593年 372年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1和TP53的目标 601年 369年 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织DN 354年 216年 所有SZGR 2.0基因通路
米利伪足趋化性DN 457年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
米利伪足趋触性DN 668年 419年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 137 907年 914年 1、m8 hsa - mir - 137 UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG
mir - 138 497年 503年 1 hsa - mir - 138大脑 AGCUGGUGUUGUGAAUC
mir - 182 927年 933年 1 hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
mir - 188 452年 458年 1 hsa - mir - 188 CAUCCCUUGCAUGGUGGAGGGU
miR-25/32/92/363/367 264年 270年 m8 hsa-miR-25大脑 CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA
hsa-miR-32 UAUUGCACAUUACUAAGUUGC
hsa - mir - 92 UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG
hsa - mir - 367 AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA
hsa - mir - 92 b深圳 UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC
miR-29 1015年 1021年 m8 hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
mir - 299 - 5 - p 301年 307年 1 hsa - mir - 299 - 5 - p UGGUUUACCGUCCCACAUACAU
hsa - mir - 299 - 5 - p UGGUUUACCGUCCCACAUACAU
mir - 329 371年 377年 1 hsa - mir - 329大脑 AACACACCUGGUUAACCUCUUU
hsa - mir - 329大脑 AACACACCUGGUUAACCUCUUU
mir - 369 - 3 - p 399年 405年 1 hsa - mir - 369 - 3 - p AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU
mir - 370 499年 506年 1、m8 hsa - mir - 370大脑 GCCUGCUGGGGUGGAACCUGG
mir - 374 399年 406年 1、m8 hsa - mir - 374 UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG
mir - 378 751年 757年 1 hsa - mir - 378 CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU
mir - 485 - 5 - p 1068年 1074年 m8 hsa - mir - 485 - 5 - p AGAGGCUGGCCGUGAUGAAUUC
miR-9 40 46 m8 hsa-miR-9深圳 UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA
mir - 96 927年 933年 1 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC