基因页:ZNF521
概括?
基因 | 25925 |
象征 | ZNF521 |
同义词 | EHZF | EVI3 |
描述 | 锌指蛋白521 |
参考 | MIM:610974|HGNC:HGNC:24605|Ensembl:ENSG00000198795|HPRD:18350|Vega:Otthumg00000179511 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q11.2 |
Pascal P值 | 0.347 |
Sherlock P值 | 0.663 |
胎儿β | -0.709 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG12338097 | 18 | 22929407 | ZNF521 | 5.86e-10 | -0.025 | 9.07e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17572651 | CHR1 | 218943612 | ZNF521 | 25925 | 0.07 | 反式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | ZNF521 | 25925 | 9.777E-17 | 反式 | ||
RS16841750 | CHR2 | 158288461 | ZNF521 | 25925 | 0.03 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | ZNF521 | 25925 | 0.2 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | ZNF521 | 25925 | 1.129E-6 | 反式 | ||
RS11738579 | CHR5 | 95119841 | ZNF521 | 25925 | 0.16 | 反式 | ||
RS13360496 | 0 | ZNF521 | 25925 | 0.18 | 反式 | |||
RS3118341 | Chr9 | 25185518 | ZNF521 | 25925 | 0.12 | 反式 | ||
RS11139334 | Chr9 | 84209393 | ZNF521 | 25925 | 0.01 | 反式 | ||
RS2393316 | Chr10 | 59333070 | ZNF521 | 25925 | 5.352E-4 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | ZNF521 | 25925 | 1.817E-24 | 反式 | ||
RS1041786 | CHR21 | 22617710 | ZNF521 | 25925 | 8.406E-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNF521_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SANA TNF信号DN | 90 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤MS | 48 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 8小时DN | 53 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Cerebellum标记 | 85 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buckanovich t淋巴细胞在肿瘤上 | 24 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 | 126 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja Islet HNF1A靶向 | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lim乳腺腔内成熟DN | 99 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |