概括
基因 25940
象征 FAM98A
同义词 -
描述 具有序列相似性的家庭98成员a
参考 HGNC:HGNC:24520|ENSEMBL:ENSG00000119812|HPRD:16808|Vega:Otthumg00000152152
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P22.3
Pascal P值 0.415
Sherlock P值 0.318
胎儿β -0.984
DMG 2(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 3
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07571117 2 33824316 FAM98A -0.024 0.34 DMG:Nishioka_2013
CG22880420 2 33824856 FAM98A 9.71E-10 -0.016 1.14E-6 DMG:JAFFE_2016
CG10083236 2 33824519 FAM98A 1.06E-9 -0.015 1.21E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CR381670.2 0.46 0.17
RP11-413E6.1 0.43 0.12
NLRP9 0.42 0.14
RPGRIP1 0.35 0.07
NUP210L 0.34 0.11
ABCA13 0.34 0.14
Lipi 0.33 0.02
FAM186A 0.32 0.19
lrrc8e 0.32 0.20
DPEP3 0.32 0.12
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC004258.1 -0.20 -0.16
FAM128A -0.17 -0.18
C1orf86 -0.17 -0.16
ydjc -0.17 -0.17
Znhit2 -0.17 -0.16
AC011491.1 -0.17 -0.18
C4ORF48 -0.17 -0.17
TMEM121 -0.16 -0.14
FAM128B -0.16 -0.22
trappc5 -0.16 -0.16

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
grabarczyk bcl11b目标dn 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramaswamy转移 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF持续 32 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因