基因页:FAM98A
概括?
基因 | 25940 |
象征 | FAM98A |
同义词 | - |
描述 | 具有序列相似性的家庭98成员a |
参考 | HGNC:HGNC:24520|ENSEMBL:ENSG00000119812|HPRD:16808|Vega:Otthumg00000152152 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P22.3 |
Pascal P值 | 0.415 |
Sherlock P值 | 0.318 |
胎儿β | -0.984 |
DMG | 2(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 3 |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07571117 | 2 | 33824316 | FAM98A | -0.024 | 0.34 | DMG:Nishioka_2013 | |
CG22880420 | 2 | 33824856 | FAM98A | 9.71E-10 | -0.016 | 1.14E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
CG10083236 | 2 | 33824519 | FAM98A | 1.06E-9 | -0.015 | 1.21E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FAM98A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CR381670.2 | 0.46 | 0.17 |
RP11-413E6.1 | 0.43 | 0.12 |
NLRP9 | 0.42 | 0.14 |
RPGRIP1 | 0.35 | 0.07 |
NUP210L | 0.34 | 0.11 |
ABCA13 | 0.34 | 0.14 |
Lipi | 0.33 | 0.02 |
FAM186A | 0.32 | 0.19 |
lrrc8e | 0.32 | 0.20 |
DPEP3 | 0.32 | 0.12 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC004258.1 | -0.20 | -0.16 |
FAM128A | -0.17 | -0.18 |
C1orf86 | -0.17 | -0.16 |
ydjc | -0.17 | -0.17 |
Znhit2 | -0.17 | -0.16 |
AC011491.1 | -0.17 | -0.18 |
C4ORF48 | -0.17 | -0.17 |
TMEM121 | -0.16 | -0.14 |
FAM128B | -0.16 | -0.22 |
trappc5 | -0.16 | -0.16 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
grabarczyk bcl11b目标dn | 57 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索B淋巴细胞网络 | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramaswamy转移 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 | 174 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
winnepenninckx黑色素瘤转移 | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF持续 | 32 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |