基因页：pnkd

概括？
基因 25953
象征 pnkd
同义词 brp17 | dyt8 | fksg19 | fpd1 | kipp1184 | mr-1 | mr1 | pdc | pknd1 | tahccp2
描述 阵发性非肺泡运动障碍
参考 MIM：609023|HGNC：HGNC：9153|ENSEMBL：ENSG00000127838|HPRD：11369|Vega：Otthumg00000133110
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q35
Pascal P值 0.675
Sherlock P值 0.358
胎儿β -0.941
DMG 1（＃研究）
主持人 皮质
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 1
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.01016
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00916

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG14849559 2 219157356 pnkd 0.002 5.008 DMG：Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016787 水解酶活性 IEA -
去：0008270 锌离子结合 IEA -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -
去：0005737 细胞质 IEA -
去：0005739 线粒体 IEA -
去：0016020 膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN 153 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江VHL目标 138 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
恩格曼癌祖细胞dn 70 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向DN 108 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇8的时间反应8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 1607年 1613年 M8 HSA-LET-7A脑 ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B脑 ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C脑 ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D脑 agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E脑 ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F脑 ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98脑 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I脑 ugagguaguugugugugugcugu
mir-124/506 1464 1470 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 1691年 1697年 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-137 1399年 1405 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-27 1691年 1698年 1A，M8 HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-30-5p 1664年 1671年 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga