基因页面:GAP43
总结吗?
| GeneID | 2596年 |
| 象征 | GAP43 |
| 同义词 | B-50 | PP46 |
| 描述 | 生长相关蛋白43 |
| 参考 | MIM: 162060|HGNC: HGNC: 4140|运用:ENSG00000172020|HPRD: 01198|织女:OTTHUMG00000133758 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 q13.31 |
| 帕斯卡假定值 | 0.18 |
| 夏洛克假定值 | 0.885 |
| 胎儿β | -0.389 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 皮质 |
| 支持 | CANABINOID 多巴胺 METABOTROPIC谷氨酸受体 5 -羟色胺 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_clathrin G2Cdb.human_PocklingtonH1 G2Cdb.human_Synaptosome G2Cdb.humanNRC G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet 潜在的突触基因 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04359 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.04047 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:5 | |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.0265 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg00216361 | 3 | 115342527 | GAP43 | -0.024 | 0.63 | DMG: Nishioka_2013 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005516 | 钙调蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016198 | 选择轴突点识别 | 国际能源机构 | 神经元,轴突(术语层面:14) | - - - - - - |
| 去:0010001 | 神经胶质细胞分化 | 国际能源机构 | 神经胶质(术语层面:8) | - - - - - - |
| 去:0007399 | 神经系统发育 | 国际能源机构 | 神经突(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0001558 | 调节细胞生长 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007205 | 激活蛋白激酶C活性 | 助教 | 3272162 | |
| 去:0009611 | 应对受伤 | 助教 | 3272162 | |
| 去:0007275 | 多细胞有机体的发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0040008 | 监管的增长 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0045165 | 细胞命运的承诺 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0042995 | 细胞投影 | 国际能源机构 | 轴突(术语级别:4) | - - - - - - |
| 去:0030424 | 轴突 | 国际能源机构 | 神经元,轴突神经递质(术语层面:6) | - - - - - - |
| 去:0045202 | 突触 | 国际能源机构 | Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) | - - - - - - |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030054 | 细胞结 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID NCADHERIN通路 | 33 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SENESE HDAC3目标 | 536年 | 332年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李神经嵴干细胞 | 146年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标G | 238年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展12小时DN | 57 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH OCT4目标 | 290年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 城堡内成神经管细胞瘤预后起 | 47 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 纳德勒高血糖在肥胖 | 58 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RORIE EWSR1 FLI1融合DN的目标 | 30. | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒18人力资源 | 178年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 亚砷酸YIH应对C3 | 36 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN神经元标记 | 69年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 近藤H3K27ME3前列腺癌 | 196年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| IZADPANAH干细胞脂肪和骨头 | 126年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 纳特GBM VS AO神经胶质瘤 | 46 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 霍夫曼PRE BI大前BII淋巴细胞 | 36 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大与H3K4ME3 ICP | 445年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 么时间响应黄体酮集群5 | 30. | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOELZEL NF1目标了 | 139年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PASINI SUZ12目标 | 315年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化了 | 570年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SERVITJA胰岛HNF1A目标 | 163年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAO受SALL4同种型B | 517年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-130/301 | 288年 | 294年 | m8 | hsa - mir - 130 a大脑 | CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU |
| hsa - mir - 301 | CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC | ||||
| hsa - mir - 130 b大脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
| hsa - mir - 454 - 3 - p | UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU | ||||
| miR-148/152 | 289年 | 295年 | m8 | hsa - mir - 148 a | UCAGUGCACUACAGAACUUUGU |
| hsa - mir - 152大脑 | UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG | ||||
| hsa - mir - 148 b | UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU | ||||
| mir - 185 | 51 | 57 | m8 | hsa - mir - 185大脑 | UGGAGAGAAAGGCAGUUC |
| mir - 191 | 385年 | 391年 | m8 | hsa - mir - 191大脑 | CAACGGAAUCCCAAAAGCAGCU |
| miR-25/32/92/363/367 | 377年 | 383年 | m8 | hsa-miR-25大脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA |
| hsa-miR-32 | UAUUGCACAUUACUAAGUUGC | ||||
| hsa - mir - 92 | UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG | ||||
| hsa - mir - 367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 92 b深圳 | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
| mir - 370 | 182年 | 188年 | 1 | hsa - mir - 370大脑 | GCCUGCUGGGGUGGAACCUGG |
| mir - 378 * | 401年 | 407年 | 1 | hsa - mir - 422 b | CUGGACUUGGAGUCAGAAGGCC |
| hsa - mir - 422 a | CUGGACUUAGGGUCAGAAGGCC | ||||
| mir - 452 | 156年 | 162年 | 1 | hsa - mir - 452 | UGUUUGCAGAGGAAACUGAGAC |