基因页:dnah1
概括?
基因 | 25981 |
象征 | dnah1 |
同义词 | DNAHC1 | HDHC7 | HL-11 | HL11 | HSRF-1 | XLHSRF-1 |
描述 | 动力蛋白轴突重链1 |
参考 | MIM:603332|HGNC:HGNC:2940|ENSEMBL:ENSG00000114841|HPRD:11790|Vega:Otthumg00000158378 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21.1 |
Pascal P值 | 0.017 |
胎儿β | -1.879 |
主持人 | 小脑半球 小脑 皮质 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
LK:是的 | 全基因组协会研究 | 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
dnah1 | CHR3 | 52409424 | G | t | NM_015512 | p.2385w> l | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LDHD | 0.83 | 0.88 |
gnptg | 0.82 | 0.83 |
克鲁 | 0.80 | 0.84 |
aldoc | 0.80 | 0.86 |
LHPP | 0.80 | 0.83 |
PTGD | 0.79 | 0.82 |
asphd1 | 0.79 | 0.81 |
MVP | 0.78 | 0.82 |
HLA-DPB1 | 0.77 | 0.82 |
HDAC11 | 0.77 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZBTB8A | -0.76 | -0.74 |
KIAA1949 | -0.76 | -0.67 |
ZNF551 | -0.75 | -0.75 |
tubb2b | -0.75 | -0.69 |
AC004017.1 | -0.75 | -0.74 |
FAM48A | -0.75 | -0.71 |
nkiras2 | -0.74 | -0.66 |
setDB1 | -0.74 | -0.67 |
ZNF311 | -0.74 | -0.70 |
mpp3 | -0.74 | -0.67 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房正常导管与小叶 | 68 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
替代孕激素靶标 | 36 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |