基因页：REXO2
概括？
| 基因 | 25996 |
| 象征 | REXO2 |
| 同义词 | CGI-114 | REX2 | RFN | SFN |
| 描述 | RNA外切除酶2 |
| 参考 | MIM：607149|HGNC：HGNC：17851|Ensembl：ENSG0000000076043|HPRD：06192|Vega：Otthumg00000168271 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11q23.2 |
| Pascal P值 | 0.638 |
| Sherlock P值 | 0.337 |
| 胎儿β | -0.085 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23656873 | 11 | 114310051 | REXO2 | 3.9e-10 | -0.013 | 7.56e-7 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003676 | 核酸结合 | IEA | - | |
| GO：0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008408 | 3'-5'核酸酶活动 | 艾达 | 10851236 | |
| GO：0030145 | 锰离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0009117 | 核苷酸代谢过程 | 塔斯 | 10851236 | |
| 去：0006139 | 核苷酶，核苷，核苷酸和核酸代谢过程 | 艾达 | 10851236 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005739 | 线粒体 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 | 157 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1目标8小时DN | 129 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hahtola sezary综合征 | 98 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Naderi乳腺癌预后DN | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王食道癌与正常DN | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard粉碎和燃烧突变体 | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UEDA中央时钟 | 88 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 修道院LIF信号1 DN | 26 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄达沙替尼的抵抗 | 81 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌BRCA1 UP | 36 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应16 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇3 | 170 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇4 | 112 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-18 | 84 | 90 | M8 | HSA-MIR-18A | uaagguggaugugcagaua |
| HSA-MIR-18B | uaaggugcaucuagugcagua | ||||
| mir-33 | 297 | 303 | 1a | HSA-MIR-33 | Gugcauuguuguugcauug |
| HSA-MIR-33B | Gugcauugcuguugcauugca | ||||