基因页面:TBC1D10B
总结吗?
| GeneID | 26000年 |
| 象征 | TBC1D10B |
| 同义词 | EPI64B | FP2461 |
| 描述 | TBC1域家庭成员10 b |
| 参考 | MIM: 613620|HGNC: HGNC: 24510|运用:ENSG00000169221|HPRD: 10892|织女:OTTHUMG00000132396 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 16 p11.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.054 |
| 夏洛克假定值 | 0.807 |
| 这样假定值 | 0.011 |
| 胎儿β | -0.32 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.01775 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TBC1D10B | chr16 | 30370664 | C | T | NM_015527 | p.491G > R | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RIN1 | 0.78 | 0.77 |
| LY6E | 0.76 | 0.77 |
| TRADD | 0.76 | 0.71 |
| RASAL1 | 0.74 | 0.77 |
| PRKCG | 0.74 | 0.79 |
| RLTPR | 0.73 | 0.70 |
| CLEC4G | 0.72 | 0.77 |
| RHBDD2 | 0.72 | 0.78 |
| MSC | 0.71 | 0.71 |
| RHPN1 | 0.71 | 0.73 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CCAR1 | -0.40 | -0.49 |
| KIAA1949 | -0.40 | -0.37 |
| RBMX2 | -0.39 | -0.54 |
| FNBP1L | -0.39 | -0.30 |
| THOC2 | -0.39 | -0.46 |
| ATAD2B | -0.38 | -0.40 |
| DPYSL3 | -0.38 | -0.24 |
| TUBB2B | -0.38 | -0.45 |
| ZNF300 | -0.38 | -0.32 |
| AC004017.1 | -0.37 | -0.32 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005097 | Rab GTPase激活活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005096 | GTPase激活活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0032313 | Rab GTPase监管活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DEURIG T细胞PROLYMPHOCYTIC白血病 | 368年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 122 | 340年 | 347年 | 1、m8 | hsa - mir - 122 a | UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGU |
| mir - 214 | 826年 | 832年 | m8 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
| miR-30-5p | 763年 | 770年 | 1、m8 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
| hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| mir - 330 | 804年 | 810年 | 1 | hsa - mir - 330大脑 | GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA |
| mir - 331 | 745年 | 751年 | m8 | hsa - mir - 331大脑 | GCCCCUGGGCCUAUCCUAGAA |
| miR-7 | 730年 | 736年 | m8 | hsa-miR-7深圳 | UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG |