基因页面:LRP10
总结吗?
| GeneID | 26020年 |
| 象征 | LRP10 |
| 同义词 | LRP9 | MST087 | MSTP087 |
| 描述 | 低密度脂蛋白受体相关蛋白10 |
| 参考 | MIM: 609921|HGNC: HGNC: 14553|运用:ENSG00000197324|HPRD: 14311|织女:OTTHUMG00000028705 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 14 q11.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.005 |
| 夏洛克假定值 | 0.474 |
| 胎儿β | -1.219 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.047 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2495622 | chrX | 117852991 | LRP10 | 26020年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs2254586 | chrX | 117855503 | LRP10 | 26020年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs2495626 | chrX | 117858917 | LRP10 | 26020年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs2250747 | chrX | 117863747 | LRP10 | 26020年 | 0.12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CCDC90B | 0.81 | 0.87 |
| C4orf27 | 0.81 | 0.83 |
| GGPS1 | 0.80 | 0.82 |
| UBE2E1 | 0.80 | 0.82 |
| C7orf36 | 0.80 | 0.83 |
| STRADB | 0.79 | 0.79 |
| TAF9 | 0.79 | 0.80 |
| ADSL | 0.79 | 0.82 |
| EFCAB7 | 0.79 | 0.82 |
| SC4MOL | 0.79 | 0.78 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.2 | -0.60 | -0.68 |
| ZBTB7B | -0.60 | -0.67 |
| AF347015.15 | -0.60 | -0.66 |
| MT-CYB | -0.60 | -0.65 |
| MT-CO2 | -0.60 | -0.62 |
| AF347015.26 | -0.59 | -0.68 |
| AF347015.8 | -0.59 | -0.64 |
| AF347015.27 | -0.59 | -0.62 |
| AF347015.33 | -0.58 | -0.64 |
| MYH14 | -0.57 | -0.66 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005041 | 低密度脂蛋白受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006629 | 脂质代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006869 | 脂质运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006897 | 内吞作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005905 | 涂布坑 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 王CLIM2 DN的目标 | 186年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名2 | 418年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合DN | 329年 | 219年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HEIDENBLAD扩增子8抓起DN | 46 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 加西亚FLI1和DAX1的目标 | 57 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER PBL肾移植好的VS捐赠 | 151年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER PBL肾移植排斥和好的DN | 51 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN脉络丛标记 | 103年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VALK AML集群4 | 31日 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 经典VERHAAK胶质母细胞瘤 | 162年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACOSTA扩散独立MYC目标DN | 116年 | 74年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KASLER HDAC7目标1 | 194年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李BMP2目标了 | 745年 | 475年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 皮德森转移由ERBB2同种型7 | 403年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 122 | 321年 | 328年 | 1、m8 | hsa - mir - 122 a | UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGU |