概括
基因 26022
象征 TMEM98
同义词 tada1
描述 跨膜蛋白98
参考 MIM:615949|HGNC:HGNC:24529|Ensembl:ENSG00000006042|HPRD:13171|Vega:Otthumg00000132882
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q11.2
Pascal P值 0.85
Sherlock P值 0.114
胎儿β 1.228
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08254353 17 31254670 TMEM98 1.132E-4 -0.529 0.029 DMG:Wockner_2014
CG03353971 17 31254616 TMEM98 2.578E-4 -0.428 0.038 DMG:Wockner_2014
CG26381501 17 31254708 TMEM98 5.815E-4 -0.432 0.049 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7830259 CHR8 14087643 TMEM98 26022 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 1 Up 36 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYCN扩增靶向DN 103 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tomlins转移DN 20 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN 98 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Changolkar H2AFY目标DN 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标组4 DN 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因