基因页:TMEM98
概括?
基因 | 26022 |
象征 | TMEM98 |
同义词 | tada1 |
描述 | 跨膜蛋白98 |
参考 | MIM:615949|HGNC:HGNC:24529|Ensembl:ENSG00000006042|HPRD:13171|Vega:Otthumg00000132882 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q11.2 |
Pascal P值 | 0.85 |
Sherlock P值 | 0.114 |
胎儿β | 1.228 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG08254353 | 17 | 31254670 | TMEM98 | 1.132E-4 | -0.529 | 0.029 | DMG:Wockner_2014 |
CG03353971 | 17 | 31254616 | TMEM98 | 2.578E-4 | -0.428 | 0.038 | DMG:Wockner_2014 |
CG26381501 | 17 | 31254708 | TMEM98 | 5.815E-4 | -0.432 | 0.049 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7830259 | CHR8 | 14087643 | TMEM98 | 26022 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TMEM98_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 1 Up | 36 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM MYCN扩增靶向DN | 103 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tomlins转移DN | 20 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN | 98 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Changolkar H2AFY目标DN | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标组4 DN | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向 | 135 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |