基因页:PTCD1
概括?
基因 | 26024 |
象征 | PTCD1 |
同义词 | - |
描述 | 五肽重复域1 |
参考 | MIM:614774|HGNC:HGNC:22198|ENSEMBL:ENSG00000106246|HPRD:11463|Vega:Otthumg00000154600 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q22.1 |
Sherlock P值 | 4.889E-4 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PTCD1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共同表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NRBP1 | 0.92 | 0.93 |
EIF2B5 | 0.92 | 0.91 |
TBCD | 0.91 | 0.92 |
NOP56 | 0.91 | 0.90 |
eif4enif1 | 0.90 | 0.89 |
火星 | 0.90 | 0.89 |
TUBGCP2 | 0.90 | 0.91 |
ATG4B | 0.90 | 0.88 |
ZNF174 | 0.90 | 0.88 |
LRSAM1 | 0.89 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.86 | -0.83 |
AF347015.31 | -0.85 | -0.82 |
AF347015.8 | -0.84 | -0.83 |
AF347015.33 | -0.84 | -0.81 |
AF347015.27 | -0.83 | -0.82 |
mt-cyb | -0.83 | -0.79 |
AF347015.2 | -0.82 | -0.82 |
AF347015.21 | -0.82 | -0.85 |
AF347015.15 | -0.81 | -0.80 |
AF347015.26 | -0.78 | -0.80 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
王攀登目标 | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌7q21 Q22 Amplicon | 76 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins UVC响应中间 | 98 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |