基因页:OSBPL3
概括?
基因 | 26031 |
象征 | OSBPL3 |
同义词 | ORP-3 | ORP3 | OSBP3 |
描述 | 氧蛋白酶结合蛋白如3 |
参考 | MIM:606732|HGNC:HGNC:16370|Ensembl:ENSG00000070882|HPRD:09474|Vega:Otthumg0000000023277 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p15 |
Pascal P值 | 0.002 |
Sherlock P值 | 0.472 |
胎儿β | -1.416 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 3 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23191354 | 7 | 25018565 | OSBPL3 | 2.684E-4 | 0.507 | 0.038 | DMG:Wockner_2014 |
CG25578967 | 7 | 25018440 | OSBPL3 | 3.407E-4 | 0.452 | 0.041 | DMG:Wockner_2014 |
CG09742170 | 7 | 25021208 | OSBPL3 | 5.28e-9 | -0.014 | 2.94E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6461794 | CHR7 | 24358496 | OSBPL3 | 26031 | 0.19 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/OSBPL3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoebeke淋巴干细胞向上 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lucas HNF4A靶向 | 58 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞发育DN | 129 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
appel imatinib响应 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kang氟尿嘧啶抵抗 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P4 | 100 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Korkola胚胎癌与精液瘤DN | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD2 DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoelzel NF1靶向 | 139 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ghandhi直接辐照 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |