基因页面:LRRTM2
总结吗?
| GeneID | 26045年 |
| 象征 | LRRTM2 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 富亮氨酸重复跨膜神经2 |
| 参考 | MIM: 610868|HGNC: HGNC: 19409|运用:ENSG00000146006|HPRD: 17454|织女:OTTHUMG00000163535 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 5 q31.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.723 |
| 夏洛克假定值 | 0.836 |
| 胎儿β | 0.866 |
| eGene | 元 |
| 支持 | G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0032 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TPI1 | 0.80 | 0.84 |
| FDX1L | 0.80 | 0.83 |
| NQO2 | 0.80 | 0.80 |
| STUB1 | 0.79 | 0.77 |
| ST6GALNAC6 | 0.78 | 0.80 |
| MDH1 | 0.78 | 0.79 |
| RUNDC3A | 0.78 | 0.80 |
| COX5B | 0.78 | 0.83 |
| CAMK1 | 0.78 | 0.79 |
| COX17 | 0.78 | 0.76 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC005035.1 | -0.59 | -0.61 |
| THOC2 | -0.59 | -0.61 |
| MAP4K4 | -0.58 | -0.60 |
| KIAA1949 | -0.54 | -0.46 |
| FNBP1L | -0.54 | -0.43 |
| SBF2 | -0.54 | -0.46 |
| ZCCHC11 | -0.54 | -0.46 |
| ZNF551 | -0.54 | -0.42 |
| AC004017.1 | -0.54 | -0.43 |
| EPB41 | -0.54 | -0.48 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOLENAAR CCND1和到的目标 | 67年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YAUCH刺猬信号旁分泌DN | 264年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大与H3K4ME3 ICP | 445年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAO受SALL4同种型B | 517年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-141/200a | 177年 | 183年 | 1 | hsa - mir - 141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
| hsa - mir - 200 a | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
| mir - 224 | 743年 | 749年 | 1 | hsa - mir - 224 | CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA |
| miR-30-3p | 320年 | 327年 | 1、m8 | hsa-miR-30a-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC |
| hsa-miR-30e-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC | ||||
| mir - 410 | 263年 | 269年 | 1 | hsa - mir - 410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| mir - 496 | 3182年 | 3188年 | m8 | hsa - mir - 496 | AUUACAUGGCCAAUCUC |