基因页：slitrk5

概括？
基因 26050
象征 slitrk5
同义词 LRRC11 | BA364G4.2
描述 缝制和ntrk喜欢家庭成员5
参考 MIM：609680|HGNC：HGNC：20295|HPRD：18065|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q31.2
Pascal P值 0.832
Sherlock P值 1.106E-6
胎儿β -0.514
DMG 1（＃研究）
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG02611934 13 88329407 slitrk5 1.379E-4 0.606 0.031 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索毛毛细胞白血病DN 80 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 107 113 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-194 1274 1280 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
mir-221/222 722 728 1a HSA-MIR-221脑 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222脑 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-346 49 55 1a HSA-MIR-346脑 ugucugccccgcaugccugccucu
mir-455 204 210 M8 HSA-MIR-455 Uaugugccuuuggacuacaucg
mir-493-5p 1183 1189 1a HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-496 1301 1307 M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc