基因页：gigyf2

概括？
基因 26058
象征 gigyf2
同义词 gyf2 | park11 | perq2 | perq3 | tnrc15
描述 GRB10相互作用GYF蛋白2
参考 MIM：612003|HGNC：HGNC：11960|Ensembl：ENSG00000204120|HPRD：11639|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q37.1
Pascal P值 5.268E-9
Sherlock P值 0.556
胎儿β 0.512

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
LK：是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP
表达 基因表达的荟萃分析 p价值：1.654

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS6704768 CHR2 233592501 Ag 3.148e-12 内含子 gigyf2


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IPI 16120600

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Teramoto OPN目标集群5 7 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-143 185 191 1a HSA-MIR-143脑 ugagaugaagcacuguagcuca
HSA-MIR-143脑 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-188 933 939 1a HSA-MIR-188 cucccuugcaugguggggu
HSA-MIR-188 cucccuugcaugguggggu
mir-30-3p 1063 1069 1a HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-30-5p 1681年 1688年 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-330 1633年 1639年 M8 HSA-MIR-330脑 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-485-3p 902 909 1A，M8 HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu