基因页：ABHD12
概括？
| 基因 | 26090 |
| 象征 | ABHD12 |
| 同义词 | ABHD12A | BEM46L2 | C20ORF22 | PHARC | DJ965G21.2 |
| 描述 | 含12个 |
| 参考 | MIM：613599|HGNC：HGNC：15868|Ensembl：ENSG00000100997|HPRD：07094|Vega：Otthumg0000000032121 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 20P11.21 |
| Pascal P值 | 0.141 |
| Sherlock P值 | 0.647 |
| 胎儿β | -1.318 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 皮质 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| 表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值：1.631 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ABHD12 | CHR20 | 25290190 | G | 一种 | NM_001042472 NM_015600 |
p.214t> m p.214t> m |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG17351116 | 20 | 25371719 | ABHD12 | 3.67E-10 | -0.01 | 7.44e-7 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6138506 | CHR20 | 25115635 | ABHD12 | 26090 | 0.18 | 顺式 | ||
| RS2268879 | CHR20 | 25177804 | ABHD12 | 26090 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS6050422 | CHR20 | 25177919 | ABHD12 | 26090 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS6083776 | CHR20 | 25186115 | ABHD12 | 26090 | 5.564e-7 | 顺式 | ||
| RS7453 | CHR20 | 25207073 | ABHD12 | 26090 | 2.349e-16 | 顺式 | ||
| RS3746337 | CHR20 | 25208271 | ABHD12 | 26090 | 5.858e-11 | 顺式 | ||
| RS6132819 | CHR20 | 25218617 | ABHD12 | 26090 | 3.314e-16 | 顺式 | ||
| RS8184820 | CHR20 | 25250576 | ABHD12 | 26090 | 1.026E-9 | 顺式 | ||
| RS2257233 | CHR20 | 25265983 | ABHD12 | 26090 | 2.687E-18 | 顺式 | ||
| RS2257991 | CHR20 | 25270338 | ABHD12 | 26090 | 2.007e-18 | 顺式 | ||
| RS2474777 | CHR20 | 25272632 | ABHD12 | 26090 | 7.986e-18 | 顺式 | ||
| RS2258719 | CHR20 | 25275842 | ABHD12 | 26090 | 7.986e-18 | 顺式 | ||
| RS1888999 | CHR20 | 25291847 | ABHD12 | 26090 | 7.986e-18 | 顺式 | ||
| RS2297497 | CHR20 | 25297908 | ABHD12 | 26090 | 2.687E-18 | 顺式 | ||
| RS7267979 | CHR20 | 25298086 | ABHD12 | 26090 | 7.986e-18 | 顺式 | ||
| RS2274890 | CHR20 | 25301021 | ABHD12 | 26090 | 3.82E-8 | 顺式 | ||
| RS6050559 | CHR20 | 25329914 | ABHD12 | 26090 | 1.914E-17 | 顺式 | ||
| RS6050565 | CHR20 | 25347562 | ABHD12 | 26090 | 5.359e-16 | 顺式 | ||
| RS4815411 | CHR20 | 25350222 | ABHD12 | 26090 | 1.025e-18 | 顺式 | ||
| RS4815412 | CHR20 | 25350324 | ABHD12 | 26090 | 1.025e-18 | 顺式 | ||
| RS6050573 | CHR20 | 25366064 | ABHD12 | 26090 | 1.374e-18 | 顺式 | ||
| RS6050598 | CHR20 | 25397256 | ABHD12 | 26090 | 1.025e-18 | 顺式 | ||
| RS12428 | CHR20 | 25433820 | ABHD12 | 26090 | 7.882e-19 | 顺式 | ||
| RS449370 | CHR20 | 25451179 | ABHD12 | 26090 | 1.99e-18 | 顺式 | ||
| RS376742 | CHR20 | 25487416 | ABHD12 | 26090 | 5.987e-17 | 顺式 | ||
| RS7272126 | CHR20 | 25488883 | ABHD12 | 26090 | 0.03 | 顺式 | ||
| RS16987806 | CHR20 | 25492189 | ABHD12 | 26090 | 0.03 | 顺式 | ||
| RS6115202 | CHR20 | 25497537 | ABHD12 | 26090 | 1.177E-7 | 顺式 | ||
| RS443009 | CHR20 | 25499816 | ABHD12 | 26090 | 5.538e-16 | 顺式 | ||
| RS6138598 | CHR20 | 25513535 | ABHD12 | 26090 | 0.06 | 顺式 | ||
| RS6083877 | CHR20 | 25520938 | ABHD12 | 26090 | 3.218e-4 | 顺式 | ||
| RS1983974 | CHR20 | 25530618 | ABHD12 | 26090 | 5.987e-17 | 顺式 | ||
| RS6138601 | CHR20 | 25539485 | ABHD12 | 26090 | 0.11 | 顺式 | ||
| RS6132862 | CHR20 | 25721247 | ABHD12 | 26090 | 0.15 | 顺式 | ||
| RS6115458 | CHR20 | 25969264 | ABHD12 | 26090 | 6.475E-6 | 顺式 | ||
| RS845778 | CHR20 | 26167546 | ABHD12 | 26090 | 0.03 | 顺式 | ||
| RS845779 | CHR20 | 26167979 | ABHD12 | 26090 | 9.858e-6 | 顺式 | ||
| RS845794 | CHR20 | 26222698 | ABHD12 | 26090 | 0.06 | 顺式 | ||
| RS845796 | CHR20 | 26225144 | ABHD12 | 26090 | 0.16 | 顺式 | ||
| RS6083776 | CHR20 | 25186115 | ABHD12 | 26090 | 1.094E-4 | 反式 | ||
| RS7453 | CHR20 | 25207073 | ABHD12 | 26090 | 5.535e-14 | 反式 | ||
| RS3746337 | CHR20 | 25208271 | ABHD12 | 26090 | 1.507E-8 | 反式 | ||
| RS6132819 | CHR20 | 25218617 | ABHD12 | 26090 | 7.891E-14 | 反式 | ||
| RS8183079 | 0 | ABHD12 | 26090 | 9.312e-9 | 反式 | |||
| RS8184820 | CHR20 | 25250576 | ABHD12 | 26090 | 2.533E-7 | 反式 | ||
| RS2257233 | CHR20 | 25265983 | ABHD12 | 26090 | 5.421e-16 | 反式 | ||
| RS2257991 | CHR20 | 25270338 | ABHD12 | 26090 | 3.905e-16 | 反式 | ||
| RS2474777 | CHR20 | 25272632 | ABHD12 | 26090 | 1.778e-15 | 反式 | ||
| RS2258719 | CHR20 | 25275842 | ABHD12 | 26090 | 1.778e-15 | 反式 | ||
| RS1888999 | CHR20 | 25291847 | ABHD12 | 26090 | 1.778e-15 | 反式 | ||
| RS2297497 | CHR20 | 25297908 | ABHD12 | 26090 | 5.443e-16 | 反式 | ||
| RS7267979 | CHR20 | 25298086 | ABHD12 | 26090 | 1.818e-15 | 反式 | ||
| RS2274890 | CHR20 | 25301021 | ABHD12 | 26090 | 8.87e-6 | 反式 | ||
| RS6050559 | CHR20 | 25329914 | ABHD12 | 26090 | 4.451E-15 | 反式 | ||
| RS6050565 | CHR20 | 25347562 | ABHD12 | 26090 | 1.313E-13 | 反式 | ||
| RS4815411 | CHR20 | 25350222 | ABHD12 | 26090 | 1.71E-16 | 反式 | ||
| RS4815412 | CHR20 | 25350324 | ABHD12 | 26090 | 1.71E-16 | 反式 | ||
| RS6050573 | CHR20 | 25366064 | ABHD12 | 26090 | 2.309e-16 | 反式 | ||
| RS6515641 | 0 | ABHD12 | 26090 | 5.802e-11 | 反式 | |||
| RS6050598 | CHR20 | 25397256 | ABHD12 | 26090 | 1.699E-16 | 反式 | ||
| RS6417589 | 0 | ABHD12 | 26090 | 1.317E-13 | 反式 | |||
| RS12428 | CHR20 | 25433820 | ABHD12 | 26090 | 1.151E-16 | 反式 | ||
| RS449370 | CHR20 | 25451179 | ABHD12 | 26090 | 3.524e-16 | 反式 | ||
| RS376742 | CHR20 | 25487416 | ABHD12 | 26090 | 1.448e-14 | 反式 | ||
| RS6115202 | CHR20 | 25497537 | ABHD12 | 26090 | 2.566E-5 | 反式 | ||
| RS443009 | CHR20 | 25499816 | ABHD12 | 26090 | 1.379E-13 | 反式 | ||
| RS6083877 | CHR20 | 25520938 | ABHD12 | 26090 | 0.03 | 反式 | ||
| RS1983974 | CHR20 | 25530618 | ABHD12 | 26090 | 1.448e-14 | 反式 | ||
| RS6115458 | CHR20 | 25969264 | ABHD12 | 26090 | 0 | 反式 | ||
| RS845779 | CHR20 | 26167979 | ABHD12 | 26090 | 0 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vecchi胃癌先进与早期DN | 138 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 | 142 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤区分良好，而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤区分井与适度的 | 109 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤MF | 47 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |