概括
基因 26133
象征 trpc4ap
同义词 c20orf188 | ppp1r158 | trrp4ap |桁架
描述 瞬态受体潜在阳离子通道亚家族C成员4相关蛋白
参考 MIM:608430|HGNC:HGNC:16181|Ensembl:ENSG00000100991|HPRD:09238|Vega:Otthumg0000000032319
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q11.22
Pascal P值 0.09
Sherlock P值 0.008
主持人 梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6088662 CHR20 33547632 trpc4ap 26133 0 顺式
RS6088667 CHR20 33566721 trpc4ap 26133 0 顺式
RS3818253 CHR20 33596875 trpc4ap 26133 0.01 顺式
RS6088678 CHR20 33607550 trpc4ap 26133 0.01 顺式
RS6120804 CHR20 33623700 trpc4ap 26133 0.01 顺式
RS6120828 CHR20 33674459 trpc4ap 26133 0 顺式
RS3746429 CHR20 33703606 trpc4ap 26133 0.01 顺式
RS6120849 CHR20 33730386 trpc4ap 26133 0 顺式
RS6088738 CHR20 33747330 trpc4ap 26133 0.04 顺式
RS2425024 CHR20 33844937 trpc4ap 26133 0.13 顺式
RS6088662 CHR20 33547632 trpc4ap 26133 0.2 反式
RS6088667 CHR20 33566721 trpc4ap 26133 0.09 反式
RS6120828 CHR20 33674459 trpc4ap 26133 0.14 反式
RS6120849 CHR20 33730386 trpc4ap 26133 0.16 反式
RS4396783 20 33741052 trpc4ap ENSG00000100991.7 4.648E-6 0.03 -60378 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Scheidereit IKK相互作用蛋白 58 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌20q11扩增子 31 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞DN 145 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIF1A和FOXA2的Qi缺氧靶标 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇5 dn 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAO AOX4靶向皮肤 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因