基因页:trpc4ap
概括?
基因 | 26133 |
象征 | trpc4ap |
同义词 | c20orf188 | ppp1r158 | trrp4ap |桁架 |
描述 | 瞬态受体潜在阳离子通道亚家族C成员4相关蛋白 |
参考 | MIM:608430|HGNC:HGNC:16181|Ensembl:ENSG00000100991|HPRD:09238|Vega:Otthumg0000000032319 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20q11.22 |
Pascal P值 | 0.09 |
Sherlock P值 | 0.008 |
主持人 | 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6088662 | CHR20 | 33547632 | trpc4ap | 26133 | 0 | 顺式 | ||
RS6088667 | CHR20 | 33566721 | trpc4ap | 26133 | 0 | 顺式 | ||
RS3818253 | CHR20 | 33596875 | trpc4ap | 26133 | 0.01 | 顺式 | ||
RS6088678 | CHR20 | 33607550 | trpc4ap | 26133 | 0.01 | 顺式 | ||
RS6120804 | CHR20 | 33623700 | trpc4ap | 26133 | 0.01 | 顺式 | ||
RS6120828 | CHR20 | 33674459 | trpc4ap | 26133 | 0 | 顺式 | ||
RS3746429 | CHR20 | 33703606 | trpc4ap | 26133 | 0.01 | 顺式 | ||
RS6120849 | CHR20 | 33730386 | trpc4ap | 26133 | 0 | 顺式 | ||
RS6088738 | CHR20 | 33747330 | trpc4ap | 26133 | 0.04 | 顺式 | ||
RS2425024 | CHR20 | 33844937 | trpc4ap | 26133 | 0.13 | 顺式 | ||
RS6088662 | CHR20 | 33547632 | trpc4ap | 26133 | 0.2 | 反式 | ||
RS6088667 | CHR20 | 33566721 | trpc4ap | 26133 | 0.09 | 反式 | ||
RS6120828 | CHR20 | 33674459 | trpc4ap | 26133 | 0.14 | 反式 | ||
RS6120849 | CHR20 | 33730386 | trpc4ap | 26133 | 0.16 | 反式 | ||
RS4396783 | 20 | 33741052 | trpc4ap | ENSG00000100991.7 | 4.648E-6 | 0.03 | -60378 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRPC4AP_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Scheidereit IKK相互作用蛋白 | 58 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌20q11扩增子 | 31 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HIF1A和FOXA2的Qi缺氧靶标 | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇5 dn | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TERAO AOX4靶向皮肤 | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |