Summary
基因 26135
象征 serbp1
同义词 CGI-55 | CHD3IP | HABP4L | PAI-RBP1 | PARMBP1
描述 serpine1 mRNA结合蛋白1
Reference MIM:607378|HGNC:HGNC:17860|ENSEMBL:ENSG00000142864|Vega:Otthumg00000009372
基因类型 蛋白质编码
地图位置 131
Pascal P值 0.055
Sherlock p-value 0.68
DMG 1(# studies)
主持人 Myers' cis & trans

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASdb Genome-wide Association Studies 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02932736 1 67896194 serbp1 1.06E-9 -0.012 1.21E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2712089 CHR2 24080273 serbp1 26135 0.16 反式
RS2348113 CHR2 201568368 serbp1 26135 0.18 反式
RS6843749 CHR4 84847249 serbp1 26135 0.2 反式
RS1324669 CHR13 107872446 serbp1 26135 0.05 反式
RS9637082 CHR21 21213235 serbp1 26135 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

No co-expressed genes in brain regions


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003723 RNA结合 IEA -
去:0003730 mRNA 3'-UTR结合 艾达 11001948
去:0005515 蛋白质结合 IPI 12505151
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0043488 mRNA稳定性的调节 nas 11001948
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 nucleus IEA -
去:0005737 cytoplasm IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0基因通路 信息
Liu Sox4靶向DN 309 191 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ONKEN眼色素层的梅拉NOMA DN 526 357 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA WITH LMP1 UP 408 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标DN 431 263 All SZGR 2.0 genes in this pathway
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
deurig t细胞促进性白血病 368 234 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BORCZUK MALIGNANT MESOTHELIOMA UP 305 185 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Choi ATL慢性与急性DN 18 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang LMO4靶向 372 227 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王攀登目标 269 146 All SZGR 2.0 genes in this pathway
OSMAN BLADDER CANCER UP 404 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION UP 1278 748 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MET的Seiden肿瘤发生 88 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHLOSSER MYC TARGETS REPRESSED BY SERUM 159 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应DN 712 443 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YANG乳腺癌ESR1激光DN 50 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
刘鼻咽癌 70 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath ES 1 379 235 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Amit EGF响应20 MCF10A 14 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿米特血清反应120 MCF10A 65 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BASSO B LYMPHOCYTE NETWORK 143 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 All SZGR 2.0 genes in this pathway
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEI MYB目标 318 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HEDENFALK BREAST CANCER HEREDITARY VS SPORADIC 50 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
江VHL目标 138 91 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JI对FSH DN的响应 58 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAMAZAKI TCEB3 TARGETS DN 215 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病初期DN 165 106 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 163 113 All SZGR 2.0 genes in this pathway
江缺氧正常 311 205 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fujii YBX1靶向DN 202 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ACEVEDO NORMAL TISSUE ADJACENT TO LIVER TUMOR DN 354 216 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌DN 540 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张乳腺癌祖细胞 425 253 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LIN NPAS4靶向 163 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王肿瘤的侵入性 374 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chauhan对甲氧雌二醇的反应 51 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vantveer乳腺癌BRCA1 UP 36 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 70 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标36小时DN 185 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAIRO HEPATOBLASTOMA CLASSES UP 605 377 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JIANG HYPOXIA VIA VHL 34 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rao由Sall4绑定 227 149 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-142-5p 610 616 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
miR-15/16/195/424/497 280 286 M8 HSA-MIR-15Abrain uagcagcacauaugguugug
hsa-miR-16brain UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
HSA-MIR-15Bbrain uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
hsa-miR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-183 6 12 1a HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
mir-26 631 638 1A,M8 HSA-MIR-26Abrain Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
HSA-MIR-26Abrain Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
mir-320 1108 1115 1A,M8 hsa-miR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-329 328 334 1a hsa-miR-329brain aacacaccugguaaccucuuu
miR-375 636 642 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
miR-377 319 325 1a HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-433-3p 262 268 1a HSA-MIR-433brain aucaugauggggcuccucggugu
mir-448 292 298 M8 hsa-miR-448 uugcauauguaggauguccccau