基因页：LRRC32
概括？
| 基因 | 2615 |
| 象征 | LRRC32 |
| 同义词 | D11S833E | GARP |
| 描述 | 亮氨酸富含32 |
| 参考 | MIM：137207|HGNC：HGNC：4161|Ensembl：ENSG00000137507|HPRD：00667|Vega：Otthumg00000133687 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11 Q13.5-Q14 |
| Pascal P值 | 0.609 |
| Sherlock P值 | 0.147 |
| 胎儿β | -0.696 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 简历：Phewas | 全球整个关联研究（PHEWAS） | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：Phewas
简历：Phewas| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7130588 | 11 | 0 | 无效的 | 1.537 | LRRC32 | 无效的 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG01048195 | 11 | 76381236 | LRRC32 | 4.403E-4 | 0.308 | 0.045 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17028592 | CHR3 | 75452818 | LRRC32 | 2615 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| BCKDHB | 0.79 | 0.80 |
| glo1 | 0.77 | 0.73 |
| HSD17B12 | 0.76 | 0.73 |
| SNX5 | 0.76 | 0.76 |
| PRDX3 | 0.76 | 0.67 |
| 斯里 | 0.75 | 0.71 |
| PRCP | 0.75 | 0.69 |
| ATPAF1 | 0.74 | 0.78 |
| PEX19 | 0.74 | 0.71 |
| HSDL2 | 0.74 | 0.79 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC135724.1 | -0.37 | -0.38 |
| FAM159B | -0.36 | -0.26 |
| AC005921.3 | -0.36 | -0.37 |
| ZNF814 | -0.35 | -0.39 |
| RP9P | -0.35 | -0.30 |
| AL022328.1 | -0.34 | -0.30 |
| AC132872.1 | -0.33 | -0.41 |
| C10orf108 | -0.33 | -0.23 |
| IL3RA | -0.33 | -0.38 |
| AC010300.1 | -0.32 | -0.23 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon | 158 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 | 182 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen malignat纤维组织细胞瘤 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindvall因TERT DN永生 | 80 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染18小时DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 | 151 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |