基因页：phgdh
概括？
| 基因 | 26227 |
| 象征 | phgdh |
| 同义词 | 3-PGDH | 3PGDH | HEL-S-113 | NLS | NLS1 | PDG | PGAD | PGD | PGDH | PHGDHD | SERA | SERA |
| 描述 | 磷酸甘油酸脱氢酶 |
| 参考 | MIM：606879|HGNC：HGNC：8923|ENSEMBL：ENSG0000000092621|HPRD：06047|Vega：Otthumg0000000012100 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p12 |
| Pascal P值 | 0.485 |
| Sherlock P值 | 0.753 |
| 胎儿beta | -0.698 |
| 耶和华 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 细胞代谢 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID：COOCCUR | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4501739 | Chrx | 35960848 | phgdh | 26227 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004617 | 磷酸甘油酸脱氢酶活性 | IEA | - | |
| 去：0004617 | 磷酸甘油酸脱氢酶活性 | tas | 8758134 | |
| 去：0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
| 去：0048037 | 辅因子结合 | IEA | - | |
| 去：0009055 | 电子载体活动 | tas | 8758134 | |
| 去：0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
| 去：0051287 | NAD结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007420 | 大脑发育 | tas | 大脑（GO期限：7） | 8758134 |
| 去：0008652 | 氨基酸生物合成过程 | IEA | - | |
| 去：0006810 | 运输 | IEA | - | |
| 去：0006564 | L链生物合成过程 | IEA | - | |
| 去：0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
| 细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg甘氨酸丝氨酸和苏氨酸代谢 | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome氨基酸合成和互转换跨跨 | 17 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长MTOR信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAZDA钻石黑芬贫血祖先DN | 66 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DODD鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IGF1和IGF2的Pacher靶标 | 35 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vanharanta子宫肌瘤具有7Q删除 | 67 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hamai凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAN对砷三氧化物的反应 | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan终端末端芽DN | 7 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌基础与毛毛毛 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Teramoto OPN目标群集7 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 | 229 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM3 | 70 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rahman TP53靶向磷酸化 | 21 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MORI前BI淋巴细胞向上 | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标1向上 | 140 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭叶丁剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jechlinger上皮到间质转变 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1 | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2向上 | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21靶向 | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM胃癌化学敏感性 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍林引用1个目标2 dn | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller被甲基化DN沉默 | 105 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多（Acevedo）正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 | 228 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 骨头DN中的乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌Luminal B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Labbe Wnt3a靶向 | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌晚期复发DN | 69 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshioka肝癌早期复发DN | 65 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu ezh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li DCP2绑定mRNA | 89 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向 | 279 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |