概括
基因 26230
象征 提亚姆2
同义词 Stef | Tiam-2
描述 T细胞淋巴瘤侵袭和转移2
参考 MIM:604709|HGNC:HGNC:11806|ENSEMBL:ENSG00000146426|HPRD:05273|Vega:Otthumg0000000015880
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q25.2
Pascal P值 0.299
DMG 1(#研究)
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG17290076 6 155316912 提亚姆2 1.19e-8 -0.022 4.92E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005089 Rho鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
去:0005085 鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
去:0005057 受体信号蛋白活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007242 细胞内信号传导级联 IEA -
GO:0035023 调节Rho蛋白信号转导的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0042995 细胞投影 IEA Axon(GO术语级别:4) -
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG趋化因子信号传导途径 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Rac1 Reg Pathway 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rho GTPases的Reactome信号传导 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Ppara激活基因表达 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Nrage通过JNK发出死亡的信号 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞死亡信号通过Nrage NRIF和NADE传导 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 81 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha1213信号传导事件 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN 260 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
瓦特自动甲状腺腺瘤 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 156 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Worschech肿瘤排斥DN 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔内成熟DN 99 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-365 354 360 M8 HSA-MIR-365 uaaugccccuaaaaaauccuuau