基因页面:KLHL3
总结吗?
GeneID | 26249年 |
象征 | KLHL3 |
同义词 | PHA2D |
描述 | kelch像家庭成员3 |
参考 | MIM: 605775|HGNC: HGNC: 6354|运用:ENSG00000146021|HPRD: 09011|织女:OTTHUMG00000129155 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 5问 |
帕斯卡假定值 | 0.028 |
夏洛克假定值 | 0.194 |
胎儿β | -0.591 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0032 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg09677741 | 5 | 137071648 | KLHL3 | 3.516的军医 | 0.461 | 0.042 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs16829545 | chr2 | 151977407 | KLHL3 | 26249年 | 0 | 反式 | ||
rs7584986 | chr2 | 184111432 | KLHL3 | 26249年 | 0.01 | 反式 | ||
rs10063752 | chr5 | 109259572 | KLHL3 | 26249年 | 0.11 | 反式 | ||
rs1030663 | chr5 | 109263809 | KLHL3 | 26249年 | 0.15 | 反式 | ||
rs16955618 | chr15 | 29937543 | KLHL3 | 26249年 | 3.502 e-8 | 反式 | ||
rs1041786 | chr21 | 22617710 | KLHL3 | 26249年 | 0.01 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KLHL3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005198 | 结构分子活动 | 助教 | 10843806 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006511 | ubiquitin-dependent蛋白质分解代谢的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005856 | 细胞骨架 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
周炎症反应生活 | 485年 | 293年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GARGALOVIC应对氧化磷脂红色的DN | 25 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应费马 | 544年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RODWELL老化肾脏没有血液DN | 150年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RODWELL老化肾脏DN | 145年 | 88年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
gabriele MIR21目标 | 289年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 149 | 2941年 | 2948年 | 1、m8 | hsa - mir - 149大脑 | UCUGGCUCCGUGUCUUCACUCC |
mir - 150 | 3828年 | 3834年 | m8 | hsa - mir - 150 | UCUCCCAACCCUUGUACCAGUG |
mir - 153 | 2827年 | 2834年 | 1、m8 | hsa - mir - 153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
hsa - mir - 153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA | ||||
mir - 183 | 3777年 | 3783年 | m8 | hsa - mir - 183 | UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG |
mir - 186 | 386年 | 392年 | 1 | hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
mir - 199 | 2417年 | 2423年 | m8 | hsa - mir - 199 a | CCCAGUGUUCAGACUACCUGUUC |
hsa - mir - 199 b | CCCAGUGUUUAGACUAUCUGUUC | ||||
mir - 200 bc / 429 | 2792年 | 2799年 | 1、m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
miR-24 | 2939年 | 2946年 | 1、m8 | hsa-miR-24深圳 | UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG |
mir - 369 - 3 - p | 2794年 | 2800年 | m8 | hsa - mir - 369 - 3 - p | AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU |
mir - 377 | 366年 | 372年 | m8 | hsa - mir - 377 | AUCACACAAAGGCAACUUUUGU |
mir - 381 | 2929年 | 2935年 | 1 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
mir - 448 | 2798年 | 2804年 | 1 | hsa - mir - 448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU |
miR-9 | 884年 | 890年 | m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |
米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 | 4002年 | 4008年 | m8 | hsa - mir - 93大脑 | AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG |
hsa - mir - 302 a | UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA | ||||
hsa - mir - 302 b | UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG | ||||
hsa - mir - 302 c | UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG | ||||
hsa - mir - 302 d | UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU | ||||
hsa - mir - 372 | AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU | ||||
hsa - mir - 373 | GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU | ||||
hsa - mir - 520 e | AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG | ||||
hsa - mir - 520 a | AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU | ||||
hsa - mir - 520 b | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG | ||||
hsa - mir - 520 c | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU | ||||
hsa - mir - 520 d | AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU |