总结吗?
GeneID 26249年
象征 KLHL3
同义词 PHA2D
描述 kelch像家庭成员3
参考 MIM: 605775|HGNC: HGNC: 6354|运用:ENSG00000146021|HPRD: 09011|织女:OTTHUMG00000129155
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 5问
帕斯卡假定值 0.028
夏洛克假定值 0.194
胎儿β -0.591
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.0032

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg09677741 5 137071648 KLHL3 3.516的军医 0.461 0.042 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs16829545 chr2 151977407 KLHL3 26249年 0 反式
rs7584986 chr2 184111432 KLHL3 26249年 0.01 反式
rs10063752 chr5 109259572 KLHL3 26249年 0.11 反式
rs1030663 chr5 109263809 KLHL3 26249年 0.15 反式
rs16955618 chr15 29937543 KLHL3 26249年 3.502 e-8 反式
rs1041786 chr21 22617710 KLHL3 26249年 0.01 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003779 肌动蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0005198 结构分子活动 助教 10843806
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006511 ubiquitin-dependent蛋白质分解代谢的过程 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005856 细胞骨架 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
周炎症反应生活 485年 293年 所有SZGR 2.0基因通路
GARGALOVIC应对氧化磷脂红色的DN 25 19 所有SZGR 2.0基因通路
周炎症反应费马 544年 308年 所有SZGR 2.0基因通路
多德鼻咽癌起来 1821年 933年 所有SZGR 2.0基因通路
佩雷斯TP53的目标 1174年 695年 所有SZGR 2.0基因通路
NUYTTEN NIPP1的目标了 769年 437年 所有SZGR 2.0基因通路
RODWELL老化肾脏没有血液DN 150年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
RODWELL老化肾脏DN 145年 88年 所有SZGR 2.0基因通路
gabriele MIR21目标 289年 187年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 149 2941年 2948年 1、m8 hsa - mir - 149大脑 UCUGGCUCCGUGUCUUCACUCC
mir - 150 3828年 3834年 m8 hsa - mir - 150 UCUCCCAACCCUUGUACCAGUG
mir - 153 2827年 2834年 1、m8 hsa - mir - 153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
hsa - mir - 153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
mir - 183 3777年 3783年 m8 hsa - mir - 183 UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG
mir - 186 386年 392年 1 hsa - mir - 186 CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU
mir - 199 2417年 2423年 m8 hsa - mir - 199 a CCCAGUGUUCAGACUACCUGUUC
hsa - mir - 199 b CCCAGUGUUUAGACUAUCUGUUC
mir - 200 bc / 429 2792年 2799年 1、m8 hsa - mir - 200 b UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
hsa - mir - 200 c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa - mir - 429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
miR-24 2939年 2946年 1、m8 hsa-miR-24深圳 UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG
mir - 369 - 3 - p 2794年 2800年 m8 hsa - mir - 369 - 3 - p AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU
mir - 377 366年 372年 m8 hsa - mir - 377 AUCACACAAAGGCAACUUUUGU
mir - 381 2929年 2935年 1 hsa - mir - 381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir - 448 2798年 2804年 1 hsa - mir - 448 UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU
miR-9 884年 890年 m8 hsa-miR-9深圳 UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA
米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 4002年 4008年 m8 hsa - mir - 93大脑 AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG
hsa - mir - 302 a UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA
hsa - mir - 302 b UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG
hsa - mir - 302 c UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
hsa - mir - 302 d UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU
hsa - mir - 372 AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU
hsa - mir - 373 GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU
hsa - mir - 520 e AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
hsa - mir - 520 a AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU
hsa - mir - 520 b AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG
hsa - mir - 520 c AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU
hsa - mir - 520 d AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU