基因页:KCNG2
概括?
基因 | 26251 |
象征 | KCNG2 |
同义词 | KCNF2 | KV6.2 |
描述 | 钾电源门控通道修饰符亚家族G成员2 |
参考 | MIM:605696|HGNC:HGNC:6249|ENSEMBL:ENSG00000178342|HPRD:12036|Vega:Otthumg0000000044541 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q23 |
Pascal P值 | 1.57E-6 |
胎儿β | -0.329 |
主持人 | 尾状基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KCNG2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
inpp5f | 0.88 | 0.89 |
LMBR1 | 0.88 | 0.88 |
OCRL | 0.87 | 0.88 |
VPS35 | 0.87 | 0.87 |
CAB39 | 0.87 | 0.88 |
UBQLN1 | 0.87 | 0.87 |
Hiat1 | 0.86 | 0.84 |
LRPPRC | 0.86 | 0.86 |
ARMC8 | 0.86 | 0.85 |
C5orf22 | 0.86 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.69 | -0.65 |
AF347015.21 | -0.69 | -0.63 |
AF347015.31 | -0.67 | -0.63 |
AF347015.8 | -0.66 | -0.63 |
AF347015.2 | -0.66 | -0.61 |
mt-cyb | -0.65 | -0.60 |
higd1b | -0.65 | -0.62 |
FXYD1 | -0.64 | -0.62 |
AF347015.33 | -0.63 | -0.59 |
PLA2G5 | -0.62 | -0.63 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
能量代谢的反应组整合 | 120 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰像肽等胰高血糖素分泌的反应组调节胰岛素分泌1 | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素分泌的反应组调节 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome电压门控钾通道 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |