基因页：GATA6

概括？
基因 2627
象征 GATA6
同义词 -
描述 GATA结合蛋白6
参考 MIM：601656|HGNC：HGNC：4174|ENSEMBL：ENSG00000141448|HPRD：09043|Vega：Otthumg00000131767
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18Q11.1-Q11.2
Pascal P值 0.804
DMG 2（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG16204205 18 19753432 GATA6 3.214E-4 -0.353 0.04 DMG：Wockner_2014
CG02634712 18 19750909 GATA6 2.29e-8 -0.018 7.61E-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PDGFB 0.62 0.58
DDAH1 0.62 0.56
ICMT 0.62 0.58
b3galtl 0.61 0.59
GRM8 0.60 0.56
Mina 0.58 0.52
CYB561 0.58 0.50
帕姆 0.57 0.60
KCND2 0.57 0.48
费希 0.57 0.59
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC132872.1 -0.32 -0.35
SNHG12 -0.30 -0.36
AC135724.1 -0.29 -0.31
FAM159B -0.27 -0.35
AL022328.1 -0.27 -0.27
KCNMB3 -0.27 -0.33
ZNF814 -0.27 -0.30
AC120053.1 -0.26 -0.35
RP9P -0.26 -0.35
AC010655.1 -0.25 -0.32

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
pid his hey pathway 48 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 132 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corre多发性骨髓瘤 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应蓝色DN 61 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima NRG1信号向上发出 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化12小时 43 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES核心九相关 100 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特（Smith Tert） 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Magrangeas多发性骨髓瘤IgG与IgA DN 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schraets MLL靶向DN 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G6 DN 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma ns 162 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因