基因页：囊

Summary？
GeneID 26278
象征 囊
同义词 ARSACS | DNAJC29 | PPP1R138 | SPAX6
描述 Sacsin分子伴侣
参考 MIM: 604490|HGNC：HGNC：10519|Ensembl:ENSG00000151835|HPRD：05135|Vega:OTTHUMG00000016562
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q12
Pascal P值 0.002
主持人 小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 RNA和蛋白质合成

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.0333

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1341306 CHR1 18564668 囊 26278 0.07 反式
RS823066 CHR1 205771172 囊 26278 0.03 反式
RS9882137 CHR3 29494146 囊 26278 0 反式
RS9882501 CHR3 29494429 囊 26278 0.08 反式
RS4491879 CHR3 189373908 囊 26278 0.14 反式
RS4505678 CHR3 189374356 囊 26278 0.11 反式
SNP_A-2169623 0 囊 26278 0.07 反式
RS9257144 CHR6 28729980 囊 26278 0.09 反式
rs16894557 CHR6 28999825 囊 26278 0.04 反式
RS4947631 CHR7 50603378 囊 26278 0.04 反式
RS17139868 CHR7 117079228 囊 26278 0.15 反式
rs1800130 CHR7 117282643 囊 26278 0.15 反式
RS2195588 CHR8 40356699 囊 26278 0.07 反式
RS16908892 Chr9 122499151 囊 26278 0.15 反式
RS12554113 Chr9 122523558 囊 26278 0.18 反式
RS917836 CHR18 20053367 囊 26278 0.09 反式
RS1503026 CHR18 70842605 囊 26278 0.05 反式
RS12326929 CHR18 70864592 囊 26278 0.01 反式
RS12327665 CHR19 39622639 囊 26278 0.11 反式
RS6040607 CHR20 11371092 囊 26278 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

补充说明:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003674 Molecular_Function nd -
去：0005524 ATP结合 IEA -
GO：0031072 热激蛋白结合 IEA -
医学杂志ogical process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006457 蛋白质折叠 nas 10655055
去：0006464 蛋白质修饰过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005575 cellular_component nd -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
COLDREN GEFITINIB RESISTANCE UP 85 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KAN对砷三氧化物的反应 123 80 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim Myc放大靶向 201 127 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WU CELL MIGRATION 184 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MANALO缺氧DN 289 166 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VANTVEER BREAST CANCER METASTASIS DN 121 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向DN 371 218 All SZGR 2.0 genes in this pathway
dazard对UV SCC DN的响应 123 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染8小时DN 47 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bild SRC致癌特征 62 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein Esrra靶向对雌激素DN的反应 41 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cheok对胃嘌呤和高清MTX DN的反应 25 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML带8 21易位 368 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 74 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MEF ICP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 38 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein ESR1目标 85 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2靶向DN 882 538 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ERBB2同工型的Pedersen转移6 29 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 863 869 1a hsa-miR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
hsa-miR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-142-5p 264 271 1A，M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 262 269 1A，M8 HSA-MIR-17-5P CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-183 1269 1276 1A，M8 HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
mir-199 377 384 1A，M8 HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc
mir-218 100 106 M8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-223 1010 1017 1A，M8 hsa-miR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-23 1232 1238 1a HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-26 556 562 M8 HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
mir-324-5p 837 843 1a HSA-MIR-324-5p CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGU
mir-543 1198 1204 M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-9 274 280 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga