概括
基因 26281
象征 FGF20
同义词 FGF-20 | RHDA2
描述 成纤维细胞生长因子20
参考 MIM:605558|HGNC:HGNC:3677|HPRD:05709|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p22
Pascal P值 0.965
胎儿β -1.036
DMG 1(#研究)
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.00057
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.03086
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02695780 8 16859295 FGF20 1.741E-4 -0.292 0.033 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008083 生长因子活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016049 细胞生长 小鬼 15592430
去:0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 10913340
去:0007165 信号转导 塔斯 10913340
去:0008543 成纤维细胞生长因子受体信号通路 经验 17133345
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 经验 1697263|9139660|11294897
|16597617
去:0005576 细胞外区域 塔斯 10913340
去:0005625 可溶性部分 塔斯 10913340

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg黑色素瘤 71 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR信号的Reactome负调节 37 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素受体信号传导级联 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR在疾病中的反应组信号传导 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR2的Reactome激活点突变体 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR1突变体的反应组信号传导 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR1激活点突变体的反应组信号传导 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR3突变体的Reactome信号传导 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR突变体的Reactome信号传导 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome FRS2介导的级联 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pi 3K级联 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的下游信号传导激活的FGFR 100 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome磷脂酶C介导的级联 54 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SHC介导的级联 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素受体的反应组信号传导 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome FGFR配体结合和激活 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome FGFR2C配体结合和激活 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome FGFR4配体结合和激活 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR的Reactome信号传导 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome FGFR1配体结合和激活 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PI3K级联 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6 140 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因