基因页:FGF20
概括?
基因 | 26281 |
象征 | FGF20 |
同义词 | FGF-20 | RHDA2 |
描述 | 成纤维细胞生长因子20 |
参考 | MIM:605558|HGNC:HGNC:3677|HPRD:05709| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p22 |
Pascal P值 | 0.965 |
胎儿β | -1.036 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.00057 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.03086 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02695780 | 8 | 16859295 | FGF20 | 1.741E-4 | -0.292 | 0.033 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FGF20_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008083 | 生长因子活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016049 | 细胞生长 | 小鬼 | 15592430 | |
去:0007267 | 细胞细胞信号传导 | 塔斯 | 10913340 | |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 10913340 | |
去:0008543 | 成纤维细胞生长因子受体信号通路 | 经验 | 17133345 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 经验 | 1697263|9139660|11294897 |16597617 |
|
去:0005576 | 细胞外区域 | 塔斯 | 10913340 | |
去:0005625 | 可溶性部分 | 塔斯 | 10913340 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg黑色素瘤 | 71 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR信号的Reactome负调节 | 37 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胰岛素受体信号传导级联 | 87 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR在疾病中的反应组信号传导 | 127 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR2的Reactome激活点突变体 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR1突变体的反应组信号传导 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR1激活点突变体的反应组信号传导 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR3突变体的Reactome信号传导 | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR突变体的Reactome信号传导 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome FRS2介导的级联 | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Pi 3K级联 | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome的下游信号传导激活的FGFR | 100 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome磷脂酶C介导的级联 | 54 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SHC介导的级联 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素受体的反应组信号传导 | 108 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome FGFR配体结合和激活 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome FGFR2C配体结合和激活 | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome FGFR4配体结合和激活 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR的Reactome信号传导 | 112 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome FGFR1配体结合和激活 | 14 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PI3K级联 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |