基因页:eral1
概括?
基因 | 26284 |
象征 | eral1 |
同义词 | CEGA | ERA | ERA-W | ERAL1A | H-ERA | HERA-A | HERA-B |
描述 | 类似于ERA的12S线粒体RRNA伴侣1 |
参考 | MIM:607435|HGNC:HGNC:3424|ENSEMBL:ENSG00000132591|HPRD:08466|Vega:Otthumg00000132675 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q11.2 |
Pascal P值 | 0.246 |
Sherlock P值 | 0.363 |
胎儿β | 0.355 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07776409 | 17 | 27182127 | eral1 | 5.12e-9 | -0.013 | 2.9e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2070265 | CHR17 | 27075422 | eral1 | 26284 | 0.08 | 顺式 | ||
RS4794836 | CHR17 | 27082709 | eral1 | 26284 | 0.05 | 顺式 | ||
RS4795457 | CHR17 | 27087928 | eral1 | 26284 | 0.05 | 顺式 | ||
RS7215310 | CHR17 | 27088625 | eral1 | 26284 | 0.11 | 顺式 | ||
RS11658884 | CHR17 | 27132741 | eral1 | 26284 | 0.04 | 顺式 | ||
RS4795465 | CHR17 | 27151497 | eral1 | 26284 | 0.13 | 顺式 | ||
RS2242345 | CHR17 | 27185826 | eral1 | 26284 | 0.07 | 顺式 | ||
RS16965255 | CHR17 | 28182193 | eral1 | 26284 | 0.2 | 顺式 | ||
RS17762315 | CHR5 | 76807576 | eral1 | 26284 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ERAL1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Laiho结直肠癌锯齿状DN | 86 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房5 6WK | 116 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ouyang前列腺癌进展DN | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |