概括
基因 26284
象征 eral1
同义词 CEGA | ERA | ERA-W | ERAL1A | H-ERA | HERA-A | HERA-B
描述 类似于ERA的12S线粒体RRNA伴侣1
参考 MIM:607435|HGNC:HGNC:3424|ENSEMBL:ENSG00000132591|HPRD:08466|Vega:Otthumg00000132675
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q11.2
Pascal P值 0.246
Sherlock P值 0.363
胎儿β 0.355
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07776409 17 27182127 eral1 5.12e-9 -0.013 2.9e-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2070265 CHR17 27075422 eral1 26284 0.08 顺式
RS4794836 CHR17 27082709 eral1 26284 0.05 顺式
RS4795457 CHR17 27087928 eral1 26284 0.05 顺式
RS7215310 CHR17 27088625 eral1 26284 0.11 顺式
RS11658884 CHR17 27132741 eral1 26284 0.04 顺式
RS4795465 CHR17 27151497 eral1 26284 0.13 顺式
RS2242345 CHR17 27185826 eral1 26284 0.07 顺式
RS16965255 CHR17 28182193 eral1 26284 0.2 顺式
RS17762315 CHR5 76807576 eral1 26284 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Laiho结直肠癌锯齿状DN 86 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK 116 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭葡萄糖剥夺DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouyang前列腺癌进展DN 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因