基因页:GBA
概括?
基因 | 2629 |
象征 | GBA |
同义词 | GBA1 | GCB | Gluc |
描述 | 葡萄糖酶,β,酸 |
参考 | MIM:606463|HGNC:HGNC:4177|ENSEMBL:ENSG00000177628|HPRD:06973|Vega:Otthumg0000000035841 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q21 |
Sherlock P值 | 0.725 |
胎儿β | -1.591 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0235 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00814 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
GBA | CHR1 | 155205048 | G | 一个 | NM_000157 NM_001005741 NM_001005742 NM_001171811 NM_001171812 |
。 。 。 。 。 |
沉默的 沉默的 沉默的 沉默的 沉默的 |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6976605 | CHR7 | 125687967 | GBA | 2629 | 0.2 | 反式 | ||
RS984325 | CHR16 | 7772248 | GBA | 2629 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GBA_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RGS19 | 0.83 | 0.78 |
Wnt4 | 0.82 | 0.80 |
PIP5KL1 | 0.79 | 0.80 |
KRT18P19 | 0.77 | 0.53 |
VAT1 | 0.76 | 0.66 |
GCHFR | 0.74 | 0.63 |
ETNK2 | 0.74 | 0.71 |
TP53I3 | 0.73 | 0.54 |
PGAM2 | 0.73 | 0.49 |
GAP43 | 0.73 | 0.72 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.33 | -0.42 | -0.63 |
AF347015.27 | -0.42 | -0.63 |
AF347015.8 | -0.41 | -0.64 |
mt-cyb | -0.40 | -0.63 |
AF347015.2 | -0.40 | -0.64 |
AF347015.15 | -0.40 | -0.62 |
AF347015.31 | -0.40 | -0.59 |
MT-CO2 | -0.40 | -0.59 |
AF347015.26 | -0.38 | -0.65 |
FOXO4 | -0.38 | -0.51 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003824 | 催化活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 18022370 | |
去:0004348 | 葡萄糖基酰胺酶活性 | IEA | - | |
去:0016798 | 水解酶活性,作用于糖基键 | IEA | - | |
GO:0043169 | 阳离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005975 | 碳水化合物代谢过程 | IEA | - | |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
去:0007040 | 溶酶体组织 | IEA | - | |
去:0006665 | 鞘脂代谢过程 | IEA | - | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005764 | 溶酶体 | IEA | - | |
去:0005765 | 溶酶体膜 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg其他聚糖降解 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg鞘脂代谢 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg溶酶体 | 121 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖磷脂代谢 | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组鞘脂代谢 | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche皮肤肿瘤启动子 | 142 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang造血细胞数量大与微小 | 44 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌1Q21 AMPLICON | 38 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JAIN NFKB信号 | 75 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
appel imatinib响应 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成8 | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存 | 73 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 | 180 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |