基因页：GBAS
概括？
| 基因 | 2631 |
| 象征 | GBAS |
| 同义词 | NIPSNAP2 |
| 描述 | 胶质母细胞瘤扩增序列 |
| 参考 | MIM：603004|HGNC：HGNC：4179|Ensembl：ENSG00000146729|HPRD：04302|Vega：Otthumg0000000022932 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7p12 |
| Pascal P值 | 0.024 |
| Sherlock P值 | 0.779 |
| 胎儿β | -0.483 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02357877 | 7 | 56032049 | GBAS | 2.5e-8 | -0.007 | 8.04e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7645488 | CHR3 | 147927667 | GBAS | 2631 | 0.14 | 反式 | ||
| RS2144280 | CHR20 | 20655465 | GBAS | 2631 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| romo1 | 0.90 | 0.73 |
| LSMD1 | 0.89 | 0.75 |
| AP000350.6 | 0.88 | 0.67 |
| MRPL52 | 0.88 | 0.67 |
| C7orf59 | 0.87 | 0.73 |
| NDUFB7 | 0.87 | 0.76 |
| DPM3 | 0.86 | 0.70 |
| C6orf125 | 0.86 | 0.68 |
| polr2i | 0.85 | 0.73 |
| CHCHD5 | 0.85 | 0.70 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| dync1li2 | -0.47 | -0.39 |
| VPS13C | -0.45 | -0.46 |
| LRP1B | -0.45 | -0.51 |
| DMD | -0.44 | -0.42 |
| myh9 | -0.44 | -0.36 |
| PDZD8 | -0.44 | -0.38 |
| cdc42bpa | -0.43 | -0.42 |
| KIAA1109 | -0.43 | -0.40 |
| SPTBN1 | -0.43 | -0.35 |
| PTPN11 | -0.42 | -0.37 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MET的Seiden肿瘤发生 | 88 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线响应集群D7 | 40 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |